GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 03:54:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

S.oleracea L. ftr A1 mRNA.
X77162.1:347-370
AATTGAAGAAGAATCTGGAGAAAGTTGGAT347GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTCTTAAAGTCTACCATGTTCCTAAATTACCTG
S.oleracea L. ftr A2 mRNA.
X77163.1:352-375
AATTGAAGAAGAATCTGGAGAAAGTTGGAT352GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTCTTAAAGTCTACCATGTTCCTAAATTACCTG
Spinacea oleracea mRNA for chloroplast ferrodoxin:thioredoxin reductase (FTR).
X78880.1:435-458
AATTGAAGAAGAATCTGGAGAAAGTTGGAT435GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTCTTAAAGTCTACCATGTTCCTAAATTACCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.091 | 0.082 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAAGGTTAAGGTGAAATCCCCTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.107 | 0.016 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGGGGATTTCACCTTAACCTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.107 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).