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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 11:20:28, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig24798.UPAS mRNA sequence.
EZ642515.1:202-222
TAAATTAAATTAAAGGAAGCAAGCTTTGCC202GGATCAAGTTACAGGTTTGTGGAGCTCCTGAAAGAGCCGAGCGCCTTCACC
Sequence 15236 from patent US 10766935.
MV658631.1:925-945
GGTGAAGGCGCTCGGCTCTTTCAGGAGCTC925CACAAACCTGTAACTTGATCCGGCAAAGCTTGCTAGGAGAGGAACTATGTC
Sequence 15236 from patent US 11566053.
OS282110.1:925-945
GGTGAAGGCGCTCGGCTCTTTCAGGAGCTC925CACAAACCTGTAACTTGATCCGGCAAAGCTTGCTAGGAGAGGAACTATGTC
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig30484.Asha mRNA sequence.
EZ678348.1:142-162
GGTGAAGGCGCTCGGCTCTTTCAGGAGCTC142CACAAACCTGTAACTTGATCCGGCAAAGCTTGCTAGGAGAGGAACTATGTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GGATCAAGTTACAGGTTTGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GGATCAAGTTACAGGTTTGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.086 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATCAAGTTACAGGTTTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.236 | 0.142 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACAAACCTGTAACTTGATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.238 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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