GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-19 11:11:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Halyzia sedecimguttata genome assembly, chromosome: 9.
OW569419.2:51784-51803
AGTGACAGAGGGGATCTGATAATAGAAGCA51784GTAAAATGCTTCCGTTATGAAAGCAAACGAATATGAGGAGAAGAATGTGC
GR__Eb0034D12.f GR__Eb Gossypium raimondii cDNA clone GR__Eb0034D12 5', mRNA sequence.
CO104522.1:4-23
AAA4TCATAACGGAAGCATTTTACTTAAAGAATCAACTTCATTACAATAAATTT
Cenchrus purpureus cultivar elephant grass chromosome A3.
CP053456.1:75518533-75518552
ACATATTCCATTTTCCTATTACAACAAAGA75518533TCATAACGGAAGCATTTTACAACAATGCTGGTATAAAAAAACACGAGTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTAAAATGCTTCCGTTATGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTAAAATGCTTCCGTTATGA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.085 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTAAAATGCTTCCGTTATGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.164 | 0.070 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCATAACGGAAGCATTTTAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.165 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).