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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-18 17:47:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A06.
CP030988.1:106168218-106168237
CAGCTTCCATCACCAAAATCGAACTTGATG106168218GTGACGTCATCTCCCTCGACGGCCACGACGTGCCGCTCCGGACGGACGGA
Cornus suecica genome assembly, chromosome: 9.
OY998246.1:15813663-15813682
CCGCCTCCATCACCAAAATCGACATCGACG15813663GTGACGTCATCTCCCTCGACGGCCGGGACCCACTCTGTACCGAATCCGAA
Leuctra nigra genome assembly, chromosome: 1.
OW203761.1:4012756-4012775
GTTGTCAGCTCTAGCGAGAATGAGAAACAT4012756GTGACGTCATCTCCCTCGACTCAAGCTGGCGCTCGGACAAGCAACTTCAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/GTCGAGGGAGATGACGTCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : GTCGAGGGAGATGACGTCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.085 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCGAGGGAGATGACGTCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.106 | 0.012 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTGACGTCATCTCCCTCGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.109 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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