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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 19:58:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KS24060H07 KS24 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD123510.1:65-84
AAAGTTGCACATTGTCTGATCTTCCTTGAG65TAACAGTTTCTGGGGGCTTCCTCCACTTCATAGATTTTGTATGACAGCTT
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig40179 mRNA sequence.
JW090423.1:302-321
AAAGTTGCACATTGTCTGATCTTCCTTGAG302TAACAGTTTCTGGGGGCTTCCTCCACTTCATAGATTTTGTATGACAGCTT
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 2, sequence.
AP026697.1:124962434-124962453
AAGCTGTCATACAAAATCTATGAAGTGGAG124962434GAAGCCCCCAGAAACTGTTACTCAAGGAAGATCAGACAATGTGCAACTTT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 2.
CP124730.1:125802583-125802602
AAGCTGTCATACAAAATCTATGAAGTGGAG125802583GAAGCCCCCAGAAACTGTTACTCAAGGAAGATCAGACAATGTGCAACTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TAACAGTTTCTGGGGGCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TAACAGTTTCTGGGGGCTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.182 | 0.173 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAACAGTTTCTGGGGGCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.199 | 0.018 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGCCCCCAGAAACTGTTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.201 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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