GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-07 08:29:42, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cannabis sativa PK23406.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449777.1:78-97
CTTATAACAGATCCATAGTTTGTTTCAATA78TCTACCGTTCTCTGTTCTTGATATATGTACATAACAGTGGTTTCATATCT
Carassius carassius genome assembly, chromosome: 39.
OY720506.1:25958675-25958694
CACAATGCACTGCTGAGGCATGACATCCTT25958675CAAGAACAGAGAACGGTAGATCAGTATCAGAATGCATAGGTCGACAAGTC
Allium cepa genome assembly, chromosome: 7.
LR994635.1:105495461-105495480
CACTAAAGAACGAAACTATCTGGACAAAGT105495461CAAGAACAGAGAACGGTAGAAAAACCTAGGAAGTCTTAAGCTCCTTCGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TCTACCGTTCTCTGTTCTTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TCTACCGTTCTCTGTTCTTG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.103 | 0.094 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTACCGTTCTCTGTTCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.125 | 0.022 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGAACAGAGAACGGTAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.126 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).