GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-19 14:03:23, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sciurus carolinensis genome assembly, chromosome: 1.
LR738590.1:12528737-12528756
ACAGAAATTAGACAAGAGTCCCTTTGTGAT12528737TGAAGGGATGTCTTTCGTGGGAACGGGAGTCGGAGACAGACTTCTCTGAG
Trifolium pratense DNA, clone:RC0651r.ab1.
DE245810.1:413-432
CCTAATCACTTGACAGTGGTTACAGTGTTG413TGAAGGGATGTCTTTCGTGGCGGTGCCACAGGCCGCAATGGAGTGTTTAT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 08_0cc.
CP125850.1:24640656-24640675
GGAGCTATGAAGGTAGTGGTTACAGTGTTG24640656TGAAGGGATGTCTTTCGTGGCGGCGCCACAGGCCGCAATGGGGTGTTTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGAAGGGATGTCTTTCGTGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGAAGGGATGTCTTTCGTGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.124 | 0.115 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAAGGGATGTCTTTCGTGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.150 | 0.026 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCACGAAAGACATCCCTTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.150 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).