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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-16 02:44:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 06_0cc.
CP125846.1:2937306-2937325
TTGTTTATGGAACAAAGACACCCACAGATT2937306TGAGTTTGGCGTCTCTCCTTTGTGTTGTTTCTGTTTTACTTTTCTGAAAA
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 06_Pall.
CP125847.1:2503800-2503819
TTGTTTTTGGAACAAAGACACCCACAGATT2503800TGAGTTTGGCGTCTCTCCTTTGTGTTGTTCTATGAAGCCCCGATACGGGA
Kwoniella sp. CBS 9459 chromosome 1.
CP144065.1:8670390-8670409
GAGGCGGTTGGGGTAGTGAGCGCGACATGT8670390TGAGTTTGGCGTCTCTCCTTCCGCTGAATCAGAAGCCTCGAAGAAAGAGA
Trifolium fragiferum genome assembly, chromosome: 1.
OX940789.1:3277186-3277205
TTGTTTTTGGAACAAAGACACCCACAGATT3277186TGAGTTTGGCGTCTCTCCTTTGTGTTGTTTCTGTTTTACTTTTCTGAAAA
Sepioteuthis lessoniana genome assembly, chromosome: 17.
OY757920.1:77805401-77805420
ACTGATGAAACTTCAGTTCTGGAGATTCGG77805401TGAGTTTGGCGTCTCTCCTTCGTTGTCATTACCCCCAGGTCGACTCTGAC
Trifolium repens mRNA, clone: WCC35k16_061, unspecified EST.
FY466526.1:18-37
TAAACAGAAACAACACA18AAGGAGAGACGCCAAACTCAAATCTGTGGGTGTCTTTGTTCCAAAAACAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGAGTTTGGCGTCTCTCCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGAGTTTGGCGTCTCTCCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.112 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGTTTGGCGTCTCTCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.221 | 0.109 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGAGAGACGCCAAACTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.222 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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