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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-07 10:54:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 9.
LR584395.1:55096555-55096574
AGCTACTAGGTACTTCTAAATCCATTACTT55096555TATTTGGGATGCACACTCCAAACGATTTAACTCATTTCTGTAAGTTAAAC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL10A18, 3'end.
FS072809.1:211-230
AATCACTCTGCGAAATAAATTAGCTACACA211TATTTGGGATGCACACTCCACCTTCTGGATTTTGTTGTTCTTTCCATATC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL11F16, 3'end.
FS073757.1:211-230
AATCACTCTGCGAAATAAATTAGCTACACA211TATTTGGGATGCACACTCCACCTTCTGGATTTTGTTGTTCTTTCCATATC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL12P08, 3'end.
FS074889.1:213-232
AATCACTCTGCGAAATAAATTAGCTACACA213TATTTGGGATGCACACTCCACCTTCTGGATTTTGTTGTTCTTTCCATATC
Solanum melongena mRNA, clone: SmFL35B23, 3'end.
FS090240.1:200-219
AATCACTCTGCGAAATAAATTAGCTACACA200TATTTGGGATGCACACTCCACCTTCTGGATTTTGTTGTTCTTTCCATATC
Sarcophaga caerulescens genome assembly, chromosome: 5.
OV656868.1:79469694-79469713
ATTTATGCACCAGAGTCATTAAAAATTGAA79469694TATTTGGGATGCACACTCCATTTTTCAAACGCGTAAAAAATGTCGATGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TGGAGTGTGCATCCCAAATA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TGGAGTGTGCATCCCAAATA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.094 | 0.085 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGGAGTGTGCATCCCAAATA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.450 | 0.356 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TATTTGGGATGCACACTCCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.455 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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