GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-01-10 22:03:38, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

PP_LBa0010-L03.F PP_LBa Prunus persica genomic 5', genomic survey sequence.
FI974132.1:383-406
TTATGCTGTTGGGAGATGAGAGATTCTTTT383TTATCTTATGCTTCCATCATGTTCATGATATTATGAATCTCTACTTATGCTAAA
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd05.
AP019301.1:34566-34589
TATGCTGTTGGGAGATGAGAGATTCTTTTT34566TTATCTTATGCTTCCATCATGTTCATGATATTATGAATCTCTACTTATGCTAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/TTATCTTATGCTTCCATCATGTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTATCTTATGCTTCCATCATGTTC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.178 | 0.170 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTATCTTATGCTTCCATCATGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.245 | 0.067 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACATGATGGAAGCATAAGATAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.245 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).