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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-01-05 20:31:10, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

SB_BBc230-C03.F SB_BBc Sorghum bicolor genomic 5', genomic survey sequence.
EI990487.1:589-608
TCCCCTTCCATGCCCATATTAAATGTCTTT589GCACCCATCTCTAACCCATTGTTGATATTTGGTAACGCAATTAGGAATTA
Sorghum bicolor cultivar Hongyingzi chromosome 6.
CP137830.1:18730638-18730657
TCCCCTTCCATGCCCATATTAAATGTCTTT18730638GCACCCATCTCTAACCCATTGTTGATATTTGGTAACGCAATTAGGAATTA
Sorghum bicolor cultivar Huandiaonuo chromosome 6.
CP137840.1:18470430-18470449
TCCCCTTCCATGCCCATATTAAATGTCTTT18470430GCACCCATCTCTAACCCATTGTTGATATTTGGTAACGCAATTAGGAATTA
Sorghum bicolor cultivar CHBZ chromosome 06.
CP142764.1:18871595-18871614
TCCCCTTCCATGCCCATATTAAATGTCTTT18871595GCACCCATCTCTAACCCATTGTTGATATTTGGTAACGCAATTAGGAATTA
Sorghum bicolor subsp. drummondii cultivar S722 chromosome 7.
CP152399.1:48872625-48872644
TCCCCTTCCATGCCCATATTAAATGTCTTT48872625GCACCCATCTCTAACCCATTGTTGATATTTGGTAACGCAATTAGGAATTA
Acropora austera genome assembly, chromosome: 6.
OZ187081.1:7403678-7403697
AACTTGAGTTGTCAATGGCCAATCACTCAA7403678GCACCCATCTCTAACCCATTTTACGGACCCACAAGAGTGACTCTCTGTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/aatgggttagagatgggtgc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : aatgggttagagatgggtgc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.195 | 0.185 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=AATGGGTTAGAGATGGGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.337 | 0.142 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=GCACCCATCTCTAACCCATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.341 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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