GGGenome | Results

2025-04-11 00:04:26, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS008F08, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY936490.1:88-111

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA88AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTATGAGATCT

Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS037D07, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY938754.1:87-110

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA87AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTATGAGATCT

Ipomoea nil mRNA, clone: JMFS148C05, 5' end sequence, expressed in flower and flower bud, cultivar: Tokyo-kokei standard.
HY947362.1:181-204

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA181AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTATGAGATCT

TSA: Ipomoea batatas Contig_16801.Ipbalsr mRNA sequence.
JP121389.1:372-395

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA372AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTCTGAGATCT

Ipomoea trifida cultivar NCNSP0306 chromosome 1.
CP025644.1:4714794-4714817

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA4714794AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTCTGAGATCT

Ipomoea triloba cultivar NCNSP0323 chromosome 1.
CP025660.1:5384131-5384154

GAGTTGGGATGATACCGGCAGGGTCCCGGA5384131AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGATAGTGAGCAACTATTCCGATTCTGAGATCT

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.384 | 0.375 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGATGGTGGAGAGCTTGAAGGAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.414 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTCCTTCAAGCTCTCCACCATCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=44
0.414 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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