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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-20 01:38:43, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 9, sequence.
AP026704.1:18609054-18609077
AAAGGTTTAGTACAAAAATGCCAACAACAG18609054ATTCTTCAACAACTCCCACAACTCAGTTAAGCGTCAAACTTATTTATTTACAGA
KS26042C06 KS26 Capsicum annuum cDNA, mRNA sequence.
GD133510.1:108-131
TCTGTAAATAAATAAGTTTGACGCTTAACT108GAGTTGTGGGAGTTGTTGAAGAATCTGTTGTTGGCATTTTTGTACTAAACCTTT
TSA: Capsicum annuum MGMT_Contig42434 mRNA sequence.
JW092678.1:1546-1569
TCTGTAAATAAATAAGTTTGACGCTTAACT1546GAGTTGTGGGAGTTGTTGAAGAATCTGTTGTTGGCATTTTTGTACTAAACCTTT
Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 9.
CP124723.1:250293545-250293568
TCTGTAAATAAATAAGTTTGACGCTTAACT250293545GAGTTGTGGGAGTTGTTGAAGAATCTGTTGTTGGCATTTTTGTACTAAACCTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/attcttcaacaactcccacaactc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : attcttcaacaactcccacaactc | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.107 | 0.098 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTCTTCAACAACTCCCACAACTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.259 | 0.152 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAGTTGTGGGAGTTGTTGAAGAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.261 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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