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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-20 16:48:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 15.
CP123890.1:90062-90081
CTCTGCGTAATGTTAGCTATTACATATCAA90062GAAAATCGCTCTGTGGAGCAACCGGAGAAAATATATGAATTTGGGAAGAT
BOT01-65L14TF BOT01 Brassica oleracea genomic clone BOT01-65L14, genomic survey sequence.
FI720358.1:641-660
ATCTTCCCAAATTCATATATTTTCTCCGGT641TGCTCCACAGAGCGATTTTCTTGATATGTAATAGCTAACATTGAGCTAAC
Brassica napus genome assembly, chromosome: C08.
HG994372.1:41568853-41568872
ATCTTCCCAAATTCATATATTTTCTCCGGT41568853TGCTCCACAGAGCGATTTTCTTGATATGTAATAGCTAACATTACGCAGAG
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C8.
LR031879.1:50806615-50806634
ATCTTCCCAAATTCATATATTTTCTCCGGT50806615TGCTCCACAGAGCGATTTTCTTGATATGTAATAGCTAACATTACGCAGAG
Agrochola lychnidis genome assembly, chromosome: 28.
OY796875.1:1311770-1311789
CGTTATTGCAATTCATAATAAATTTTCTAG1311770TGCTCCACAGAGCGATTTTCATATTTCCATTGAGTCATCATCAGCTTATA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/gaaaatcgctctgtggagca
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : gaaaatcgctctgtggagca | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.107 | 0.099 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAAATCGCTCTGTGGAGCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.181 | 0.074 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGCTCCACAGAGCGATTTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.184 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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