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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-11-22 15:14:48, GGGenome : Drosophila willistoni genome, dwil_caf1 (Jul, 2008)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

scf2_1100000007178 dna:supercontig supercontig:GCA_000005925.1:scf2_1100000007178:1:1171:1
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position: 297-311
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position: 717-731
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position: 196-210
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position: 763-777
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position: 463-477
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position: 121-135
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position: 84-98
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position: 1127-1141
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position: 1675-1689
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position: 3995-4009
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position: 2818-2832
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position: 778-792
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position: 3975-3989
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position: 21907-21921
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position: 41663-41677
TTACCTGTTGTAGTTTTTGAAGTTATTAAT41663TTCATTGACAACATTTTTAATATTATTGCATTGAATTCGAATAAC
scf2_1100000004904 dna:supercontig supercontig:GCA_000005925.1:scf2_1100000004904:1:77927:1
position: 64231-64245
TACCTGTTGTCGTTTTTTAAAGTTATTAAT64231TTCATTGACAACATTTTTAATATTATTGCATTGAATTCGAATAAC
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position: 100849-100863
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position: 1130817-1130831
TTTCCAGTGGTTGTTTTTGAAGTTGTGACT1130817TTCATTGACAACATTTTCGACATTATTGCGTTGAATTTAAATAGC
scf2_1100000004958 dna:supercontig supercontig:GCA_000005925.1:scf2_1100000004958:1:2682060:1
position: 319238-319252
TTTCCAGTGGTTGTTCTTGATGTTATGATT319238TTCATTGACAACATTTTTGAAATTATCGCGTTGAATTCAAAAAGC
scf2_1100000004514 dna:supercontig supercontig:GCA_000005925.1:scf2_1100000004514:1:3904529:1
position: 2506273-2506287
TTAGAAGTGGATAACTGACCTTTACTTGGT2506273TTCATTGACAACATTTATTAAGATATCAATTTTCTTGTGACTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/dwil_caf1/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : dwil_caf1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

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0.113 | 0.020 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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