GGGenome Help | Japanese

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NOTICE:
nyaan

2025-05-16 03:24:18, GGGenome : Human genome, GRCh38/hg38 (Dec, 2013)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:14713370-14713388
TGCAATGCTCCTGGTAGACACAGGCACCTG14713370ATGATCTCAGATCTTTAACAGCACAATCATTTCAGTGCTGATCACTGTC
chr1:35226683-35226701
ATTGTAGGCATGAGCCATCGCTTCCCAGCC35226683ATGATTTCTAAACTTTAAACATTATTCATTGACTTCTTAAGGTAAGTGA
chr1:48481898-48481916
TCTTTCTATACTGATTATTGAGATAATCAT48481898ATGAGCTTTCAACTTCAACCAATTTATGAAATAAATTATATCAATAGTT
chr1:51420674-51420692
CTCACTGCCAGAGAGAGAATTATATTGATG51420674ATGATCTCTTAACTTGCACTGCCTTCAGGAAAATTCAAGTAAATATAAT
chr1:52636175-52636193
TGGATTGGAAAAGTTATTTAACTTCCTAGT52636175ATTTTCTCTCAACTTTAAAATGGTGATAGAGATATTTGTGTGATAGTAC
chr1:52636307-52636325
TGGATTGGAAAAGTTATTTAACTTCCTAGT52636307ATTTTCTCTCAACTTTAAAATGGTGATAGAGATATTTGTGTGATAGTAC
chr1:52636439-52636457
TGGATTGGAAAAGTTATTTAACTTCCTAGT52636439ATTTTCTCTCAACTTTAAAATGGTGATAGAGATATTTGTGTGATGGAAT
chr1:56663631-56663649
GTGCAACAGTTTTGACACCCATTGAGTGGA56663631ATGTTTGCTCAACTTTAACTTTTTAGGCAGAGTTGTGTCAAACTAAATC
chr1:57426395-57426413
AATCCGGGCATAACATGTAGATACCCACCA57426395ATGATCTTTCAAGTTAAACTAAACCAAATCTTAAAGGAACATTTTAAGT
chr1:59106203-59106221
CATTCCTGTCTGAGGGTTTCAGGTTCGTCT59106203GTGATCTCTAAACTTTAACATTCAGTCTGTGCACATTGGTGGCCCCAGA
chr1:59412596-59412614
AAAGATGTGCAGTGTTTAAACTCCTTCTCT59412596ATAATCTCTTAACTTTCACACTATCACATTTTCATTCATTTATTCCAAT
chr1:60798312-60798330
ATCTTGCTGGTCACTGTGATCATCTACATG60798312ATGATCTCTCAACTATCAGTTTCCAAGTCATCTTGCCTGGCATATTCCC
chr1:65842240-65842258
GACACAAAAAAACACTAATAAATACTATGT65842240ATGGTCTCTCAACATTAAGAAAGTGGTTTTTTTTGCAGGAAATACAAAA
chr1:70028486-70028504
TGATAAGTGCATTTTTTTCCTAAAATATAA70028486ATGATCTCTCTACTTTTTCAAACTATGAGGGTTGCATTTAATCAGTCAT
chr1:78728760-78728778
CTGCTATGTTAATTTGGAAATTATCTATAA78728760ATGATCTCTCCACTTTAACTGGTTGGAATTCAAATGTCTCCCAGCCTTG
chr1:80255262-80255280
TAGTGTCATGTGCTTACTTAAAATTCTCCA80255262ATGATCTCTCAACTTATTCAAAATCATATTTTTATTCTGCTTTGGCCTG
chr1:86906203-86906221
AACTGTGACTTTATTGGTTAATTTGTGTGT86906203TTGATCTCTCTAGTTTAACTATAAGACACTTGCTACCATACTAGTACTT
chr1:95718199-95718217
TAAAACAATTTAATAATACCGATAGTCATA95718199ATAATCTCTAAACTTTAAGTTGGTATATTGTTAAGCACTTTGCATGGAT
chr1:104273599-104273617
CCATTCTATGCTATCTTTGTGATATCTCCT104273599ATGTTCTCTCAGTTTTAACTACTAACTCTCAACTTACATCATAGGAATT
chr1:112134751-112134769
TGTTTGGCCAGCTCCTCAGGACTACCTAAG112134751ATGGTCTCTCAAGTTGAACTGACTCTACAGGTGCTGAAGAAGCCAGTTA
chr1:113670450-113670468
TTCAGCTTTCTCAATGGAAACTGCTTCTTA113670450ATTATCTCTTATCTTTAACATGAGATTTTCACTATTGTATTCTAAGATT
chr1:115234578-115234596
TTTATGTAGCAATAAATGGCATATTATTTC115234578ATGATATCTCAACTATTACCTTGAACTCTTATTGTTATTTAACATTTCA
chr1:115772225-115772243
AACAAGCCTGTTAGCAACCCCAAGGCCCTC115772225CTTTTCTCTCAACTTTAACAGGTGGTCCCTGGAGCCTTCCTGCCTCCTC
chr1:147485737-147485755
TTTATAGACTTGGTCATTTTTCCTAGAAAC147485737ATGACCTCACAATTTTAACTGTTAGTATAAACTGATAGTATAAACAAGC
chr1:160445555-160445573
CAACTGGATATGTGTCAAGTGACTAATGGG160445555ATGATATCTCAATTTTAACTTCACTATCACTATCCCAGTCTGGAATAAG
chr1:164252675-164252693
AATAAAAATAATGGATCAGGTTATTAATTT164252675ATTATCTCTCAACTCTAAATTTGACTTTTATTGCCTGCTCTGCAAAAGT
chr1:165485491-165485509
CACCTGCCCCCAAACAGGGTGCTGGAACAA165485491ATAATCTCTCAATTTTACCCAGCTCTATTCGAATTCATTTATGATTCTA
chr1:169730645-169730663
CAACTGAAAAAGAAACCCAAATCAGTTCTG169730645CTCATCTCTCACCTTTAACAGATAAGAACACTGGAAACTAGAACTACAG
chr1:176887478-176887496
AGTCACCAAGCCCTGTTGGTTCTGCCCCAG176887478ATCATCTCTCAATTTTATCCTCTCCGTACTATAATGGCCAAGAACATGC
chr1:178690939-178690957
CTTGTCTGTAAAATGAAGGAATTGGATGCA178690939ATGATCTCTCAACTTCCAGTTCTAAAAATTCCGTAAGAAAATGGGATCT
chr1:180522189-180522207
TTTCTTCCAATCCATGGTGCTTGTCCAGGC180522189ATGATCACTTAACTTTAATGCATGGGAGAAGAAGCTATGTACTTCCTAC
chr1:184277614-184277632
TCTAGTATCACCTATGGACTTTGGGAGATA184277614ATGATATGTCAACTGTAACAAATGTATCATTCTGGCAGGGATGTTGATA
chr1:200376152-200376170
AGACATGGTCATCTCTCATCTAGACTATTA200376152ATGGTCTATCAACTTTCACCATTGCCCCCTTACAGTCTATTCTCAACAG
chr1:200442876-200442894
TTATCTATTTGTTGTAGTATCCAGAGCAAG200442876ATGATCTTTGAACTTTACCCTCTTTATGTTGTGGTTATTTTTGATGGAG
chr1:200636305-200636323
AACCTCATATGAATCCTTGAATCATTTACA200636305ATGATCTCTCATTTTTAAAAAAAAGTCAGAAATGCATCATCACCCAATA
chr1:217085955-217085973
GCCAACCTAAAAACTGAATTGCAAAGCCGT217085955ATGATTTCACAGCTTTAACAAACTGACAACAAAGTGACAAGAGAAAACT
chr1:237695084-237695102
GCATATCAGATTATAAAACAGAACTGGCAT237695084ATGATATGTCAAATTTAACATTGAGAATTCCTGAGTTATAGAAACTTTA
chr1:243561524-243561542
GTACAGATAACATTTAAATATTCTGATCTT243561524ATGATCCCTCACCTTTAAAAAATTGCATTTGCTATCTATCATCAAAGAT
chr1:245535152-245535170
TATGTCCCTAAATAATACAATTATACGTGA245535152ATGATTTCTCAACCTTAACCTTCTCTTCTCTGTGTCATTGAAGTGCTAT
chr1_KI270763v1_alt:573632-573650
GTACAGATAACATTTAAATATTCTGATCTT573632ATGATCCCTCACCTTTAAAAAATTGCATTTGCTATCTATCATCAAAGAT
chr1_KI270759v1_alt:229456-229474
TATGTCCCTAAATAATACAATTATACGTGA229456ATGATTTCTCAACCTTAACCTTCTCTTCTCTGTGTCATTGAAGTGCTAT
chr2:7220411-7220429
GTTTCACATCAGTTTTTTATCAGCTTAACA7220411ATGATTTCTGAACTTTAATTTGCATATATTATAACATGGGTTTCAACAT
chr2:8145823-8145841
ATCTGAAATTCTTTTATTATATTTCTTCCA8145823ATGATCACTCAACATTGACTGGTTGGATAGGATGAGCTGAAAAGCAAAA
chr2:12620942-12620960
ACAGGAAACTGCGGCATCATTTCCTTTGAA12620942ATGATAACTGAACTTTAACTAGACACCTAGGAATCACCTTAGAGAGAGG
chr2:15213853-15213871
TCCAAATATTTGCAGGACCAATTAAAACGG15213853ATGTTCTGTCAACTTTAATCATTTTAGGAAAAAAGACACAAGGAGCTAT
chr2:17729635-17729653
TGAATGCCCCTCAAGATTCTCCCAACACCC17729635ATGATTCCTCAACTCTAACTTTTGGTTTTCCTGATTCTAATAAATTGTC
chr2:20758202-20758220
ACAATCTTTATTTATTTTCATGTCAAATAT20758202ATGATCTCTGAACTTTTATAAAAGTAATGATAATTTTAAAAATTGTTGA
chr2:21668899-21668917
CTTATTGTCATCACTTCCCTCCAGGTCTTC21668899ATGACCTCTCAACTTTATTTTTGCTACAGCCTCTGCCTGATATTACCTC
chr2:24617338-24617356
GTACAAAAATCCTTCTCGAAACTGAACGTT24617338ATGATCTCTCCACCTCAACTTCTGCTGGTTTTCCTTTTACCTCTATCCA
chr2:28799403-28799421
GTAAAACCATCCAGCCATTTGACACCCTTT28799403ATGATGTCACACCTTTAACTTAAGGAGACGGGTAAAGGATCTTAAATTT

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/en/hg38/3/-/nogap/GTTAAAGTTGAGAGATCAT
lang : en | db : hg38 | k : 3 | strand : - | nogap : true | query_string : GTTAAAGTTGAGAGATCAT | format : html | download : | debug : 

0.012 | 0.012 | search_start;
5.004 | 4.992 | search_minus_done; http://172.18.8.138:28017/match?q=ATGATCTCTCAACTTTAAC&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
5.017 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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