GGGenome | Results

Help | English

2025-04-15 13:51:03, GGGenome : Rhesus genome, Mmul_10/rheMac10, D3G 23.02 (Feb, 2023)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr2
position: 113358661-113358675

GCCTGTTTTTCATATGCATATGTAATAGGG113358661AATGTTGTCAATGAAAACACAATAGTATTTGGAGTGCAGCATAGT

chr11
position: 78709330-78709344

GTAAGATAGGTTTGTTCCAGAAGTTTAAAA78709330AATGTTGTCAATGAATTTGATAAAATTTAATATTCACATTAGAAG

chr14
position: 41003831-41003845

GTTTGCTCTATTCACTGTCCTCAACGCTAG41003831AATGTTGTCAATGAACAAGACATATCTATGTTCCTGGAAACTCAA

chr19
position: 40093681-40093695

ACTCCCTTAGGAGAGCTGTAACATTATACT40093681AATGTTGTCAATGAAAAGCTAAGACAGGCCAGGGGTGGTGGCTCA

chr19
position: 40144780-40144794

CTCCCTTAGGAGAGCCGTTAACATTATACT40144780AATGTTGTCAATGAAAAAGCTAAGATAGGCAGGGCGTGGTGGCTC

chr5
position: 146527341-146527355

CAGAATATATTATCGCTTTGAACACAGATT146527341TTCATTGACAACATTTTGTGGGCATCCATTTAATATTAATATTAA

chr5
position: 163209068-163209082

TAAAACCTCTGATTTTGTGTAACACTCCTT163209068TTCATTGACAACATTAAACAGCAATTAACTATTTGCTGACTACAT

chr5
position: 178769009-178769023

TTTGGACCCCCAGATCAGTCTTCATATTCT178769009TTCATTGACAACATTCATGAAGTTCTGCAGAAATTAGATAGAATT

chr5
position: 183557954-183557968

GCCTGAGCCACCATGCCCAGCTTGCTATTC183557954TTCATTGACAACATTCACTTAAACAAACAAACATCCATAAAATTA

chr16
position: 13890825-13890839

GCCTCTGGGCCTATATTAGATGGGCCATGC13890825TTCATTGACAACATTGATTTTATGTTTATTTGTGAAAGGGCAGAA

chr17
position: 49200745-49200759

TGTTCAAAGTTTTCCCCTCCAATGTATCTT49200745TTCATTGACAACATTCGGATTTATCACATCAATCAGTCAATAAAT

chr17
position: 66037760-66037774

GCAGTCTGGAGGTTCTCCCTGGAGGCTGTA66037760TTCATTGACAACATTGCCTGAGGTAACTCACACTGAGGTGACAAC

chr19_NW_021160375v1_random
position: 158477-158491

GTGAGCCACCACGCCGGCCTATCTTAGCTT158477TTCATTGACAACATTAGTATAATGTTAACAGCTCTCCTGGCAATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

タブ区切りテキスト → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトに直接コピペできます。
CSV形式 → 表示 | ダウンロード
エクセル等の表計算ソフトにて開くことができます。
BED形式 → リンク | ダウンロード
GFF形式 → リンク | ダウンロード
JSON形式 → リンク | ダウンロード

Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28953/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.090 | 0.008 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28953/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.096 | 0.006 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).