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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-04-19 03:38:30, GGGenome : Chicken genome, ICGSC Gallus_gallus-4.0/galGal4 (Nov, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr3:92660230-92660244
TAGCAGACTTGTAACCTTTATGAATCTGTA92660230AATGTTGTCAATGAAATGGCTTCTAAAGATGATTAAACACCATAT
chr4:11202588-11202602
TTCAGGGTACAGCCACAGTCCCTGATGTTA11202588AATGTTGTCAATGAAATGTCATGAGTGCTGTTCTGCAATAAGGCT
chr2:3543467-3543481
ACTTCACACTCTACTTGCACAGAGTTAAAA3543467TTCATTGACAACATTGCTCTAAATCATCAGACAAGGATGTAATGG
chr14:14609061-14609075
AAGAGGGGGTGGTGAGAGAGGAAGCTGTGC14609061TTCATTGACAACATTCCTTGATGTTGTTGCCACTGGTAGAGTGGA
chr21:754139-754153
TGCAGCAAATATTTTAAAGAAAACATGAAA754139TTCATTGACAACATTAATCAACAAATATTATTCAACTTATATTGG
chrZ:49811250-49811264
CATGATAACAATCTGTGTCATGTAATTGAG49811250TTCATTGACAACATTTAAGTAATCCATAGCTCGTTTCCATTGTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/galGal4/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : galGal4 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28072/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28072/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.088 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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