# [ GGGenome | 2024-12-08 17:10:59 ] # database: Human pre-spliced RNA, RefSeq curated protein coding on hg38.p12, D3G 21.01 (Jan, 2021) # query: TTCATTGACAACATT # count: 7 # query: AATGTTGTCAATGAA # count: 11 # name strand start end snippet snippet_pos snippet_end query sbjct align edit match mis del ins NM_001301128.2|MAGI2;9863|chr7:78017054:79453667:-|prespliced::chr7:78017054-79453667(-) + 731566 731580 TACAATTTCCTAGATTAAACAATACATTCAAATGAGGTAATGAATTATGTGTTTTAAGAGCAGAATGAGCTATATTTGTTATAGAATATTATGTTAAATCTTCATTGACAACATTAAAGAGTCATACCTTTTATGGGTGTTAGTTAATTACGTATACTTATTTCCTTGGAACAAGATATATTTTACAAATAAAAAAGTTTTTCTATAATATTTTG 731466 731680 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_001304840.3|HECW2;57520|chr2:196194071:196362177:-|prespliced::chr2:196194071-196362177(-) + 149028 149042 ACTATTAACATTGGCTCCACAAAGAATAAAAGTACATTCGGAGGGAAAAAATTAAAAGAACTTAATTGCATGACAGTATAGTTATATGAGAAGCAACTTCTTCATTGACAACATTGTCATCACCCTTAATGAAATGTGGGGCATTACTTAGGTGTAAAAAAAGATCTGTAAAATTGGTTCTGGCCTAAAGAGATTCTTTTATATTATCAAGTCCA 148928 149142 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_001348768.2|HECW2;57520|chr2:196194071:196593554:-|prespliced::chr2:196194071-196593554(-) + 380405 380419 ACTATTAACATTGGCTCCACAAAGAATAAAAGTACATTCGGAGGGAAAAAATTAAAAGAACTTAATTGCATGACAGTATAGTTATATGAGAAGCAACTTCTTCATTGACAACATTGTCATCACCCTTAATGAAATGTGGGGCATTACTTAGGTGTAAAAAAAGATCTGTAAAATTGGTTCTGGCCTAAAGAGATTCTTTTATATTATCAAGTCCA 380305 380519 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_012301.4|MAGI2;9863|chr7:78017054:79453667:-|prespliced::chr7:78017054-79453667(-) + 731566 731580 TACAATTTCCTAGATTAAACAATACATTCAAATGAGGTAATGAATTATGTGTTTTAAGAGCAGAATGAGCTATATTTGTTATAGAATATTATGTTAAATCTTCATTGACAACATTAAAGAGTCATACCTTTTATGGGTGTTAGTTAATTACGTATACTTATTTCCTTGGAACAAGATATATTTTACAAATAAAAAAGTTTTTCTATAATATTTTG 731466 731680 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_014296.3|CAPN7;23473|chr3:15206245:15252916:+|prespliced::chr3:15206245-15252916(+) + 42038 42052 TAAATAAATAAATAAAAATAAAAAAATAAAAACACATTATAAAGGGGGCAATCCAGATGGCCAGTAAACCATTGTAATAGCCAGAAATTGGAAACATATATTCATTGACAACATTTAAGATTATAATATAGTCATATAATAGTCCTGATATAACAATGGAAATAAATTACAGCTACACACAACATAATGGATAAGTCTTAAAAAGCCACATGTAC 41938 42152 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_020760.4|HECW2;57520|chr2:196194071:196592983:-|prespliced::chr2:196194071-196592983(-) + 379834 379848 ACTATTAACATTGGCTCCACAAAGAATAAAAGTACATTCGGAGGGAAAAAATTAAAAGAACTTAATTGCATGACAGTATAGTTATATGAGAAGCAACTTCTTCATTGACAACATTGTCATCACCCTTAATGAAATGTGGGGCATTACTTAGGTGTAAAAAAAGATCTGTAAAATTGGTTCTGGCCTAAAGAGATTCTTTTATATTATCAAGTCCA 379734 379948 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_152744.4|SDK1;221935|chr7:3301251:4269000:+|prespliced::chr7:3301251-4269000(+) + 222790 222804 TCTGTACATTCTCCTTTGAGTCTGGATCCTTGATCCTGGCCTGTGATTCCATCTCAGGAGTTAGAAGCCTGTGGTGCCTGGCCTGAGTCAGCTCATTAGCTTCATTGACAACATTGGTTCGTTCAACAAATATTGCCTGAGAAGAAGACATTTAAGCAAAGACCTGCAGGAAGGAAGGGAGTTAACTAAGTGGATATGTGGGGCAAGAACTTCCC 222690 222904 TTCATTGACAACATT TTCATTGACAACATT ||||||||||||||| =============== 15 0 0 0 NM_001080448.3|EPHA6;285220|chr3:96814593:97761532:+|prespliced::chr3:96814593-97761532(+) - 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