GGGenome Help | Japanese

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2024-04-28 05:03:16, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:5666773-5666791
GATTTCCAATATATGGATATACCACAATTT5666773ACTCATTTATCTATTAATGAATACTTAACCTACTTCCAATTTGGGGCTG
chr1:10617697-10617715
GAGCTGCTAATCCTAGGTTAAAGAAAATGG10617697ACTTGTTTTCATTTTAATGTACATTGCTAACCTGTGCTTTAAAAAGGTG
chr1:29373309-29373327
CTTCATCAGTTGATATAATAAAATGATTTT29373309TCTCCTTTTTATGTTAATGTGGTATATTATTTTTACTTTCAATTTTTAA
chr1:35620562-35620580
CATCTATATATAGAACATCTTGTTCCATAT35620562TCTTGTTTTTATATTCATGTTCAATTACTTTTTAAGTCTCATTTCTTAG
chr1:35784892-35784910
AAGATTGCTTTGCATGGTTTCAGCTTGCAT35784892AGTCGTTTTTATATTTCTGCGTGGTAGCTGCCTGTATAAAAAATATAAT
chr1:55977491-55977509
CCAATCTCCTGGGACTGTTGTGGAGATTAA55977491ACTCGTGTTTATATTAAGCTATGTAATCTCCCTATCCAGGTCTTTTTGA
chr1:56406098-56406116
CAGTCAAGTTGACTCATAAAATTAGCCATC56406098ACTCGTTTTGATGTTAATAAAATATCCCAGACTGGGTGGCTTAAACAGC
chr1:61583240-61583258
ACAGTTTTTATATTAATGTAACTATATAGG61583240CATAGTTTTTATATTAATGTAACTATACAGCACCTATTTTTGTGTTTTA
chr1:76735818-76735836
ATAAAGAATTCATAAAGTTGAAATTATTGA76735818ACTTATTTTGATATTAATGTACTTTTTTACTCTGGTTGTCCCAAAATAT
chr1:77274909-77274927
TGTGTGGGGGGGTATAAATATTTTATATAC77274909ATTCATTTTTATATAAATGAATTGCAGATTTGTCCTATTTTTTATATTT
chr1:78329608-78329626
GGTGAAAAATCTAAATTTTTATGATGTTGT78329608TCTGGATTTTATATTAATGGACTCCTTTGAAGATTTGGAAAACCCACCC
chr1:78618133-78618151
ACTTTAAAAATAGGAAAACTTTACATGCTA78618133ACTTGTATTTACATTAATGTCAAACTAACAAATTGAATTTAGAACTATA
chr1:86561768-86561786
AACTCTCAATTTGAGATTTCTTCTCTGTAA86561768ACTCGTATTAATAATAATGAGCTTTAGGACCAAATTCTCTATGGATTAT
chr1:86642315-86642333
GAAATCTTAGTCATGTTTAAAGGCTTTATA86642315ACACTTTTTTAAATTAATGGAATTAAATTGTTAATGGAATAATTTATGT
chr1:98491051-98491069
CTGTGCTTCACTGATCTGGTCAGAATATGG98491051ACTTCCTTTTATATTAATGAGGATTTTGTTCTGTGTTTGAAGCCATGAA
chr1:99181485-99181503
GTCTGTTTAATCATATTCACACACACACAC99181485ACACGTTTTTATATCTATGATGTATTTCTGTATTTACATATATATAAAA
chr1:101243398-101243416
AACTCCATCAGAAGAGTTTGTGCTTTTATT101243398ACTGTTTTTGATATTAATGAAGAGCCTTCTTCTCAAAGAGGTGGAGGTC
chr1:103675429-103675447
TGTTTGTGAGATTTTAATCCATTTTTAATG103675429ACTTATTTTTACATTAATGGCAATTATCGGTCGATTAACTCAATAGACA
chr1:104632861-104632879
ATCTACTTTTGGAAATATTTCAGTGACGAG104632861ACTAGTTTTTATATTATTTTTCTTTCGGTCAAGTTTAATAAAGGTCTGC
chr1:108117077-108117095
TTCTTCATAAGAACCTCAATCAAAGTAAGG108117077ACTAGTTTTTATAAAAATGAAACAAAACAAAACAAAAAAACAAATTAAA
chr1:108307965-108307983
TACCACATACACAGTCATAGAATAAGGGTC108307965ACTCATTTTTATAGTAATGACTAATTTGTAGTTCCAACTTTGAATGAGA
chr1:118161522-118161540
ACAGTTTTGCTGTTAGCAGTTTTGCTATTA118161522ACTTGTTTTTCTATTAATGAGTCTTGATAAGCATTTCACAGTCATACAG
chr1:119890230-119890248
GCTTGCAAAAAGAACTTCTTGGGTCTAAAC119890230AGTGGTTTTTATCTTAATGGAAATATAACAGCAGATTTAGAGCAGGCAG
chr1:157306403-157306421
CTTCTTTTCTTTATAACTTACTGAGTCTCA157306403AGTTCTTTTTATATTAATGCAAGAATGGCCTAGTACATTTTGCTAAACT
chr1:158144470-158144488
AATCACAGTATGTTATGGTTAAATATATCC158144470ACTCTTTTTTATATTCCTGGCACCAGGATGAAAAAAAAATCTTTAAGTA
chr1:159676840-159676858
GGACTATTACAAATGGTGGTACATTTCTGG159676840ACTGGTTTGTATTTTAATGATGTATAGTTTTAAAATTTTTAATATCCTT
chr1:163306758-163306776
AGCAAATTGCTGTATTGCCTTTAGAATTGA163306758ACTCATTTTTATATTTATATTAACTTGCAGATTTTAGTTACTGGATAGC
chr1:163378516-163378534
CGTGTGCATACTTCTTACCAAGCATATAGT163378516ATTCATTTTCATATTAATGAGGCTAAAACTGTAGCCACAATGTGTTCTA
chr1:166087773-166087791
AATCCAGCACTTGACAAACTATGGCCTACT166087773GCTTGTTTTTATATTAATAAATGAAGTTTTATTCAAACACAGCCATGCT
chr1:166304458-166304476
CAGATTCAACTCCCAGCTCTTTCCTTCAAT166304458ACCAGTTTTCATATTAATGCTTCCCTTTTTCATTTTAGGCATTCCCCTT
chr1:167942677-167942695
TGAATATTCTTTCCTAACAGTCTTTCCCCC167942677AGTGGTTTTTATATTAATTGATGACTTCTGTTTGAATCGGTTGTTGTAA
chr1:169159165-169159183
CAGGTTAATTCGTGTTCCAAATATTAAGTA169159165GCTCTTTTGTATATTAATGTACGTCAGGAGCCAACAAAAGTTTTGCTAT
chr1:187693370-187693388
TAGGATTGCTTAATTCTTATACATAAAGTA187693370ACTCTTTTTTATATTAAACTGGTATCACATGATCTTGTTAAATTCACAT
chr1:188200081-188200099
GAAAGTGTGGGAAAGAAAGAAGTGGGTTAA188200081ACTCGTCTTTTTATTAATATAAGAATAAAAAGTTATTTTAACATAATAT
chr1:189612763-189612781
TATGAAATATAAATAAATGAATAATAAATT189612763ACTTTTTTTTATATGAATGGACTTGTGACTGGGCCAATATATAGTTAGA
chr1:190611661-190611679
AATAAATAGATAATTTCATGTATATCATTT190611661ATTCGTTTTAATGTTAATGAATTCTATCTTTCATTCTGTCTTTCAATTT
chr1:193569001-193569019
ATAAAGAGTGATTAAATCTAATTAATCTAT193569001ACCTGTATTTATATTAATGGTCTAGTGTTCTTTTATAAAGTAAAGAATT
chr1:196114210-196114228
TAACTATATTACATATTTTACTCAGATTTC196114210ACTAGTTTTTCCATTAATGCCTGAAATCAAACCAGGACACCACATTGCA
chr1:207364034-207364052
AATCTTTGAGAAGCTGATCTAACAAAAACC207364034TTTAGTTTTTATATTAATGTATGTTACATAAAATTATGTTTAAATGGAT
chr1:207410360-207410378
TGTGACAGTTATTTACATTATTTTAAAAGT207410360ACTAGATTTTAAATTAATGAGATTGAAGCCATAATAAAAAGTCTTCCAG
chr1:215200214-215200232
AACATATACATACGTCCTTATCTTAGGAAG215200214ACTAATTTTTATATTAATTTATTCCATTTGAAAACAGGGCATGTAATTT
chr1:215630350-215630368
TGTTCATTGCTGCTAGCATGCTGTTCAAGA215630350AATTGTTTTTATATTTATGCTTCATTGGTCTAAGGATACGCTGGTCACA
chr1:225259026-225259044
AGTGTGTTTTTACAGTAGTTGGTAATGGTC225259026TTTCATTTTTATATTAATGCTTCCTTTAGGAGCTCCTATAAGGCAGGTC
chr1:226434738-226434756
ATTTATCGTCTCTTCTCTTCTAAATTTTCC226434738ACTCATTTTTATCTTCATGTTTCATTCGGGATATTTTCTTCTGATCTAT
chr1:238966739-238966757
TCCCAGATTGCTTTGGGTAGAAATAAACAA238966739ACTCATTTTAAAATTAATGTAAAAATGCAAGAGACCTAAAATAGAGAAA
chr1:241495718-241495736
CATTAGAACCATGGGAAAGAATGCCAGAAA241495718AATAGATTTTATATTAATGTAAGGAACTAATTTATAATCGTTTGAGGTG
chr1:241889491-241889509
TAGTATAGGCCTGAGCCATGGCACTGGGCC241889491AATCGTTTTTATATTGATTATATATTGAGGTGATAATAATTTGGCTATA
chr1:248429860-248429878
ACATTTGTTAAGGGATCGTGTGAGACATTC248429860ACTCATTTTTATTTTATTGTCATTCCATTACTTGTTAACTCTTTCTACT
chr1:248437428-248437446
TTAGTGGTAAAGTGTTATGATTTTTATATT248437428ACTCGTATTAATATTATTGTGTTTTTGTTATGTATACTGATGGAAAAAG
chr2:4574778-4574796
GAAAAATTCTATTTTAGATTTACTTTAACT4574778ACTCTTTTTTATACTAAAGTTATGTTTTCCTTTTAAATAGATGCTTATT

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/ACTCGTTTTTATATTAATG
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : ACTCGTTTTTATATTAATG | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
7.415 | 7.405 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=ACTCGTTTTTATATTAATG&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
7.427 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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