GGGenome Help | Japanese

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2024-05-05 01:23:40, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:1763182-1763200
TACTGGGATTACACGCACCCGGTCACATGT1763182AGTAATTGTAGCTGCTTTATTATAATTAAAATAGGTCTGGGCGCGGTGG
chr1:1790404-1790422
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chr1:11325468-11325486
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chr1:26704008-26704026
AGTAATATTATATAGTAGACATTTGCTAAA26704008AGTAATTTTAGGTACTTTTACCGCACACACACACAAAAGGTAACTGTGA
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ATCGAAATCCAAAAAGCTAACAAAGACCTT58425568ATTAATTGTGGCTTCTTTATAAACAGTTTTTTTCACTCTTCTTTCTCCT
chr1:58433348-58433366
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chr1:67982816-67982834
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chr1:75162520-75162538
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chr1:86149903-86149921
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chr1:88662409-88662427
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chr1:98408490-98408508
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chr1:100678354-100678372
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chr1:114376207-114376225
AAAAGGCAGAGAATATTTGCCTATCAGCAT114376207TGCAATTGTAGGTACTTTAAAATGTTTAATTATTTTTCTGATCTCTCAA
chr1:145810802-145810820
CACCGATTCTTGGAAAGCTTTTCTTTATCT145810802ACTAATTGTGGGTGTTTTATGTCACCTTTCCTCAAATACATATGCTTCC
chr1:152291376-152291394
CATAACTAAAATAAGAGTGCTATTATACAG152291376AATATTTGGGGGTACTTTAAGGAAAGGAGGTTTTGTGGTAGAGGGGACA
chr1:154491564-154491582
CCTTATTTTATGCCTCTGTGCAATGAGTAT154491564AGTAATAATGTGTACTTTATAGGGTGGTTGTGAAAACCAAATGGAATAA
chr1:158039610-158039628
CCCTGAGCCTTAGCTTTTTTTATTAAGGAT158039610AGTAATTGTGCCTACCTTATTGGGTTGTTGTGTATAAAAGTGGCAGTGG
chr1:160865823-160865841
CAAAGGAGATCATCTGTGTCCCTTCATACC160865823TGGAATTGTGGGTATTTTACACTGTTTGGAAGAAAGCTAAACCCTGAAG
chr1:169878350-169878368
CCCCTGTGTCCTGTTGCCTGAACTACAAAC169878350AGTAATTGTAGTTACATTATAACATCAGCATCTGCCACATCTGCTGGAA
chr1:170013324-170013342
AGTTGAAATGTTTATATAGGATTTTTGTAA170013324AGTAATTGTGTATTCTTTACCTAAATGTCTTATGAAAATGGATATTGTA
chr1:183654900-183654918
GTTTCCTTCAGACCTAACATGTGGTAATAC183654900AGTAATTTTGTGTTCTTTAGCTTGTCTGCTGCTTTTGAAAATTCTTTTC
chr1:189531212-189531230
GGACAGAATCAACTGTTAGCATGGGACAGC189531212AGGAATTGTGGGTGTTTTAGGGCTATATATATATATTATATATAATTTA
chr1:195038322-195038340
CTATAAGAGAGCAATATCACGATTGCACCA195038322TGTAATTGTGGTTACTTTTATCACTACAATTTGGCTCATTCTCTATGAC
chr1:195639364-195639382
ACCCGTGATTTGGCTCTCTGACTCCCATAT195639364AATAATAGTGGGAACTTTAACACCCCACTGCCAATATTAGACAGGTCAA
chr1:211570177-211570195
AAAACAAATAAATGGGAAAAAAGAAAGGTT211570177AGTAATTGTGAGTAATATAAGAATAAGATTTGGCTATTAGAGGATATTG
chr1:219355318-219355336
GTTGTTATTTAAAATAGTGTAATAGGAATG219355318AGTAATTGTGGGTATTTATATATAATACTAATATTTTAATTGTGTAATA
chr1:219990295-219990313
TCTAAAATTCCTTAATTTTAAGATTCATCC219990295AGTAACTGTAGGTACTTAAAACCCATGGAAAATCTCATGACTGTAAGAG
chr1:222194740-222194758
AATTTGAATGACTGGGAAGAGACGGGATTG222194740AGTAATTGTGGGATCTTGACTCAGTACTCAAACTTCCAACACTCTAAAT
chr1:231808495-231808513
CTTTCAGACAGCTTCCTTTTCAATCTCAGA231808495AGTACTTGTAGATACTTTACCCACCTTGTCTGCCTTGGCATTATTGTAC
chr2:2188771-2188789
CTTTACTTTTGTCATCTCTGAAATGCAAAT2188771AGTAATTGCGTCTACTTTAGAAGGCTTGTCAGAGGATCCACTGAGACAG
chr2:6011275-6011293
ATGTCTATGTTAAATATTTTATTTACGTTT6011275AGTATTTGTGAGTACTATATGCCAAGTAGTTAATGCATCTCACTCACAC
chr2:7405886-7405904
CTCCTGTGCCAATTACGCCATTGACTTCCC7405886AGTAACTGTGGGAACGTTATCAAAGCTCTGAGCCTCAATTTCTCCCTCA
chr2:12234822-12234840
TTTATGCATTGGTAACTTGGCACACCATTG12234822AGTAATTGTGTATACTTTTGCCTATCTTCGAGCTCTCATTATGTTTCTC
chr2:20985706-20985724
TGCTGCTTCTTCCATTAGAGTTCTCAACGT20985706AGTAATCATGGTTACTTTAAATTCCCGATCTGATATTTCTAAAATTGGT
chr2:21452686-21452704
GGGTGAATCCTTGGATGTGCAGGGATACTT21452686ACTAATTGTAGGTGCTTTAATTATTTTAATCTGGGAGTTTTCCTTTGCT
chr2:24118178-24118196
TAAATTAAACTTAATTTTAGTCAGTTTCAG24118178AGTAAATGTCGGTAATTTACTATGAAACTGACTAAAATTAAGTTTTCTT
chr2:39224630-39224648
AGAAGGAAAATGCAAGTTTTTTTCTGTTTC39224630ATTAATTGTGGGTATATTACACTGTACCATCTCAGTTGCCAAAACAAAA

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/AGTAATTGTGGGTACTTTA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : AGTAATTGTGGGTACTTTA | format : html | download : | debug : 

0.011 | 0.011 | search_start;
6.594 | 6.583 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=AGTAATTGTGGGTACTTTA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
6.606 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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