GGGenome Help | Japanese

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2024-05-03 18:39:33, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:624346-624364
AAACAACCTAAGGTCATGTTTCTGTGAAGT624346CCATCCTTTTGGTCTTTAAATTTTATTATCCTCAAAGGTCAATTATGAT
chr1:31003733-31003751
TCTGCTTCCCTCCAAACCAAACCCCCTTGC31003733CCATCCTTTTCCTGTTTACCATGTCACTAATAAGGATTATTTCACATCC
chr1:69068927-69068945
ATATATTATGCTTTTCTTTCTCTCCTCCCT69068927CCCTCCTTTACTTCTTTAATTTTTTATTTCTCCCTTCTTGCCTTTTTAT
chr1:77591599-77591617
TCTTATTGCAGATTATTTTCTTGGCTCTTT77591599CCATTCTTTACGTCTTTTATTGAACTTTTGGAATATCTATCTTCCCTTG
chr1:80936302-80936320
GTTAAATATGAAAATTTAATCCTGTGATTG80936302CCATCCTTAAAGTGTTTCAGTGGCTTCTAATGCTGCAAAGATAAAATCC
chr1:83666443-83666461
GTTTCATGCACTATCCTCTGACCTTGATCC83666443CCATCCTTCACGTATTTTACATATACCTACCCTTTCTTAATTGGTTTTC
chr1:88801703-88801721
AAACAGCAAGTGCAAAAGCCCAGAGGCAGA88801703GCATGCTTAACGTGTTTAAAAAATAGCACAATAAATATTAGCTACTCAG
chr1:91922048-91922066
TTCCTTTGTTTAGCCCATTCTGCCTTTACC91922048CCATCCTTTACCTATCTAATACCAACTTTCTCTTCAAGGCTCAGTTCAA
chr1:98548778-98548796
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chr1:152802729-152802747
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chr1:165083366-165083384
TCTGCTATCCTTTTAGGCAAAACTCAACTC165083366CCATCCTTTCCGTAATTAAAGTGCAGAAATCAGATATCTGAACTTGACC
chr1:172933910-172933928
TACTCTTTTCCTTGCTGCTCTATTTGTCCT172933910CCCTCCTTTCCGTCTTTAAAGTGTGTTTAATTAAAAACCACATTGTAAG
chr1:180141302-180141320
CCTCTCTTCATCCCCATCCTCCTTCCCTTC180141302CCATCCTTTCCTTTTTTAAGGGTTAGACTAGAAGGATTCGAATCTATCT
chr1:209020476-209020494
CATTATAAGCAGCAGGAGGTTACTGGTTTG209020476CTATCATTTACGTGTTAAATGAGTTCAACCTGCTAGTATAGGGGATGAG
chr1:220218363-220218381
CATTACTGCAACCAATATGCCAAAACATTA220218363CCATCTTTTAAATGTTTAAAATGGCTATTAAGTTGTGTTTTTGTTCAAC
chr1:222638551-222638569
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chr1:224059953-224059971
CAGTTTTCCCAGGACAATTTGTGGCATAGG224059953CGATCCTTTCCCTGTTTAATTATCTTGGCCCTTTTGTCAAAAACCAATC
chr1:230749259-230749277
CTCTGTAGTCCCATAACACTGTTAATGATT230749259CCATCCATTCGGTGTTTAATTTTGTACCTTGCAGTAATTGTTGAGGTTT
chr2:33236089-33236107
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chr2:46216771-46216789
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chr2:56727560-56727578
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chr2:68810486-68810504
AGTGTTGTCTATACTTGCTGTCACCAGTGC68810486CCATCCTTTAAGTCCTTAAAATTGTAACAGAAAAACATCAAAAGAACTA
chr2:80268481-80268499
TAATGGAAGTGGTATGACAAAGAATATTTG80268481CTATTCTTAACGTGTTTAAGAAATAGGCTATTTAATGGATGCTGTATAC
chr2:136744963-136744981
CCGGTGACAATAGGAATGTGATGGAGACTA136744963CCAACCATTACGTCTTTAAGGGTTGCACTGATCTCCACTATTCCCCTTG
chr2:145565739-145565757
ACAAAATGGTGATTTTTTTTTCTAATTCCA145565739CCATCCTTTATGTATTTAGTAGTTGGCATTCTTCTAAAAGAAAATTTTT
chr2:159864505-159864523
TCTTCACAAATTAACATTTTCTAAGATTGT159864505CAATCCTTTACGTGTTTCTGGACCTAAAATATCACTTGAAGAGAGATTA
chr2:187469574-187469592
TTTAAAAAATGAATCTCAGTTTATGGCACT187469574CCATCCTTTCAGTGTTTAGGCCAGAATCTGGAGCTGTGTTTGACATTGA
chr2:191393946-191393964
ACACAAACAAACAAAAACATGAATGGGAAC191393946CCATCATTTACCTGCTTAAAACCCTCCAATGGTTTCCTTTTACACCATT
chr2:195659929-195659947
TCTCATGACCTGAAGCACAGAGTCTTAAAA195659929TTATCCTTTAGGTGTTTAAACTACTTTAAATGATCTACCTACACCAACA
chr2:200917204-200917222
TATAGTCTTACCACATTTTAATTTTCCTCC200917204CCATCCTTTACTTGTTTCCATTATTATCTCTTTTTCAGCTTTTCTTTCC
chr2:204275914-204275932
CACTGATAAAATGTTTGTGAATAGTAGTTT204275914CCCTCCTTTATGTGTTTATTTTATTGTATTATCCTTTCCTTTTAATGTA
chr2:217484865-217484883
GGCCCTTGGAAATGCTGGCTGGGTCGCTTT217484865CCATCCTTTATTTGTTTAGCTTTGCCTGCTTCTCAGTGGCCTCAGGAGG
chr2:236358535-236358553
GAGGCTGAAGCTGGTCTGTGGGAAGCTCTT236358535CCAGCCATTACGTGTTTAAATCATAAGCTGAGGCCTCAGTGCTCACGGC
chr2:236732482-236732500
AAAGCATGTGGTTACTAAGAGACAACATGA236732482CCATCCTTTGTGTGTTTATGTATCTAGCAGGCTCATTGATTCCCAGCAG
chr2:238799368-238799386
TTTCTCAGTTAACTGAAACATGCTGCATAG238799368TATTCCTTTACGTGTTTAATATCCCTTAGACTCAAGCTTATGCCTCCAC
chr2:239967545-239967563
CTGAGTGGAAACCCTTTTCAATCTGTAATT239967545CTAACCTTTACGTGTTTACTTTTTTCTAAACAAAGGTGTTGGGCCTAGA
chr3:5301836-5301854
TGCTGAAGAGTAGGCACGGTTAAACCATAA5301836CCATCCATTACTTGTTTAGCTGGCGTTTCTGTAAGTTGCTTATTGCCCA
chr3:17927892-17927910
CCTTACCCAGCTTAATTGTTCAAACTCATG17927892CCATATTTTACTTGTTTAATATTTGAATAATTTTTTTCTGATACTAGTC
chr3:33113792-33113810
CTCAATCATTGTTACTTCTGTTTGCTTCCC33113792CCATCCTTTTCCTTTTTAAGCTATTTATTTAATGATTTCTGATGATTAA
chr3:36679478-36679496
CCCAATAAATCTAAGCATATTTCTCATTGT36679478TCATCCTTTATGTGTATAAAATCATCATGGCAGAAATAATTTCCCAACA
chr3:39749652-39749670
TTGTTTATTGGTTCTGGGCTGGTGATGTAT39749652CCATCCTTTAGTTGTTTCAAAGGGCAATCATATATGGGGGTCACCCTCC
chr3:48001689-48001707
ATGCCCATTTTGCCCCTCCACATGCTGCAG48001689CCATCTTTAACCTGTTTAACTTAATGATTATAGTTTTGTTTTTCTTTTT
chr3:48053536-48053554
ACCTGCCTTCCCGTTTGGCATGATTGATCC48053536CCATCCTTCACCTATTTAACCTGTACCTACCCTTTCCTAATTGGTTTTC
chr3:58886569-58886587
TCTTTGGCCATAAAGCCATCATAAAATGAT58886569CCATTCTGTAGGTGTTTAATATCTTTGAAGAGGATCTTAACTAGCTGTA
chr3:72274648-72274666
GTCTCTATTTGATGTTACATTGTCCTCATA72274648CCTTCCTTTACTTCTTTAATCATGGTTTCCTTTAATTCTCTGAACACAT
chr3:89540463-89540481
TTCTGACACATAGATAGGTGTAGTTTTTGC89540463CCATCTTTTACTTCTTTAATTTTTCTTTATTTTCTTTGTTGGGCTTTCG
chr3:101663600-101663618
GGCTCAGAGATATTTTGTGACTTGGCCAAG101663600TCATCCTATACGTGGTTAAACTAGGACTTAAATTCAGGTTTTCTTTACA
chr3:142218523-142218541
AATCCCACTGTGACAATTTCCAAGCTGCTT142218523CCACTCTGTACGTGTTTAATTCATCTGTCCACTCGGACCTATTAAAAGA
chr3:142695209-142695227
TATAGATATTTCCATGAAATACCATTGTAT142695209ACATCCTTTACATTTTTAATACCTTTAGGATGTTTAATACAGATCACAT
chr3:143388151-143388169
GTGTGGGCTGGACACTGACTTTCAAAACTT143388151CCATCCTATACGTCTTTGAGCATTACTGAGAATAAACTGCTTTCATTTA

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/CCATCCTTTACGTGTTTAA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : CCATCCTTTACGTGTTTAA | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
6.490 | 6.480 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=CCATCCTTTACGTGTTTAA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
6.502 | 0.011 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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