GGGenome Help | Japanese

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2024-04-29 22:55:41, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:7892264-7892282
TTAATATTCCCTTTTCCTTTTAATGTCTGT7892264AGGTTTTATAGTAATGTACCCCTCTTATTGCTGGTATTAATATTTTTCC
chr1:9139899-9139917
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chr1:10351800-10351818
AAAAAAAAAAAAGGAATAGCCTCTTCTTTT10351800CTTTTTTATATTAATATGCATATCATTTATGAATTATTGACTATCCCAA
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CTGAATTTGGTTTGCTAGTATTTTGAGAAA22767387TATTTTTATATTAATGTTCATAATGGATATTAGTCTATAGTTTTCTTTT
chr1:31496081-31496099
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chr1:45498970-45498988
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chr1:53604342-53604360
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chr1:61583212-61583230
AAAAAAAAATGTAGATTCCTGGATAGGCAC61583212AGTTTTTATATTAATGTAACTATATAGGCATAGTTTTTATATTAATGTA
chr1:61583243-61583261
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chr1:65739908-65739926
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chr1:66333285-66333303
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AAGAATTCATAAAGTTGAAATTATTGAACT76735821TATTTTGATATTAATGTACTTTTTTACTCTGGTTGTCCCAAAATATCTC
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TATAGGCAACTACAATTTTAGTATTATTTT86209451AGTTTTTATATTAATCTAGGGCAGAAAAATATCTTTAGAAGTTAAGTGT
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AAACTCATGGAGAAAGTTGGGAAAGGGATA89108500TGTTTTTTTATTTATGTACCTACAGGAGAACTAGAGAGAGATTTGTTTC
chr1:96724662-96724680
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chr1:98710028-98710046
CAACTGTGATTATTGCTTTTAAGGAGCGTT98710028CTTTTTTTTATTACTGTACAGGTGTCTTTTACTTGTTTTCTAATAATTT
chr1:102214539-102214557
CCAAATTATGGAGCTTTCCCTGTGGTTCTG102214539CATTTTTATATTATTGGACTGTTCTAAAAGTGGCAATTTTTCTAATTTC
chr1:104604945-104604963
TGCTGCAAATGCAGCACATTTACCTTAAAA104604945TGTATTTATATTAATTTACTGAGAGTAAACATGTTCATCTCTTTTGGGT
chr1:106251774-106251792
GTCCAATAATTTGATCAAAATCACATAAAT106251774CTTTTTTATTTTAAAGTACAGCCTGATTCACAGCCTTAATCTTCTCCCT
chr1:116316542-116316560
GATCCACATTCTCCTACGTTTTTGACCTTT116316542CTTTTTTATGTTAATATACCATCTCTCAATATCTCTCCTTAGGAGTTTT
chr1:145241188-145241206
TTTCAAGGAGGAAGACATGTTTCTCCGCTT145241188CGTTTTTATTTAAATGTACCACTTGGGATTTGAAGCTTCCGCACTTCTT
chr1:146321606-146321624
CAGATTATCAAGCTTTGGCTTCCTTTTTTC146321606ATTTTTTATTTTAATGTACAGGGATTCTCGTAGAGCCAGGGGCTCAGTT
chr1:150163333-150163351
TAAATCCCTTAGGTGAAGGAAAATTCCTTA150163333GGTTTTTATATTAAGGAACTGTGGCAGGCAGAATAATCCCTCCTCACCC
chr1:151001515-151001533
TCTACAGCTGTCCTATAAGGACCTCTCTTA151001515GGTTCTTATATTAATGTACTTACATGAGGTCCCTTGACCTGTTTCTGGA
chr1:152780242-152780260
TACAGTAAACTATCCTTGATTCTGCAGCTT152780242TGTTCTTATATTTATGTACCCCTCAACAGTTTCTACAACAGAGGTGGAC
chr1:158129590-158129608
TTTACAGTTTGCATGTATAATTCAAATCTG158129590GGTTTTTATATTCATATACAGCCTTGGGAAAAGTTTTTTAAAAAGATTA
chr1:160610703-160610721
GAACATTATAGTTATTGTGGTGGTGGTGGT160610703TGTTTTTACATTAATATACTGGGAAGCATGTTGGATTTTCTTCCACCAC
chr1:162405077-162405095
TGCAATGCTTTCTTCTGGTACATTTATAAG162405077TGTTTTTATGTTAAAGTACTAGACCTAATTTTAATTAAACTTGATCTAA
chr1:165415491-165415509
ACCAAGGGTTCATGTCTATTCCCAACCTAT165415491CCTTTTTCTAATAATGTACTTCAGTTTACATAGATACCCTCACAGTGAG
chr1:167017804-167017822
AAAATACCATAAAGACAATAGGCATAAAAA167017804CGTTGTCATATTAATTTACCAGAGATCAATAGGAATATTTCTCTATTGA
chr1:169159168-169159186
GTTAATTCGTGTTCCAAATATTAAGTAGCT169159168CTTTTGTATATTAATGTACGTCAGGAGCCAACAAAAGTTTTGCTATTGA
chr1:170960888-170960906
TAATTAGTTCATTTTTATTTAGGATTTTTT170960888AATTTTTATATTAATCTACATATTAATTTATATTCCCATGCCAGTTTTT
chr1:176398567-176398585
TTTTCACCCTGGCTTCTACAAAAGTCCAGT176398567CTTTTTTTTTTTAATGTACATTTTAAAGTCACCAAAGGATCTTATATCA
chr1:178392308-178392326
TTTTAACAACTGAATCTTTGTATGCTACAG178392308TGTTTTTATAATAATGTACCTCACTTCTCTATTGATGGATATTTACATT
chr1:180855582-180855600
CAGTTGACTTCTGCTGTTTGAATTCCCCAG180855582TGTTTTTACATTAATGTATCCTATGGCCAGTTTAGTCTTTCTTCAACTG
chr1:187640512-187640530
TCTCCATTTGAAGTATGTTCATATGACATT187640512TGTTTTTATATTCAAGTACTTTATTTTACCAGTACTGCAAAATACCTTA
chr1:188271057-188271075
TTTAGTAATTCCTTTTAATATTTATTTGAT188271057CATTTTTATATTACTGTATTAACATAGATTTTTATAAATGGCAGATGTA

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/CGTTTTTATATTAATGTAC
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : CGTTTTTATATTAATGTAC | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
7.301 | 7.291 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=CGTTTTTATATTAATGTAC&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
7.313 | 0.011 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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