GGGenome Help | Japanese

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2024-05-07 03:48:16, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:7272251-7272269
TTTGGGTTAATCTCTACCCCCTTTCTCTCT7272251GGTTATGTTATTCTTGGAAATAAAATATAATTAGGCTCTTTTGTTTTTT
chr1:51166034-51166052
CAAATCATTTGGAGTCGAACGCAGCCCCCG51166034GCCTTTGTAATTCTAGTAAAGCACTTAAAGTGCACAGTAGGTGTTCATG
chr1:52290092-52290110
CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCC52290092GGCTATCTAATTCTTAAAAATAAAACACATGAAGCAAGAATGCCCTATA
chr1:64272290-64272308
TTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCCA64272290GACTATTTAATTTTTGTAAATAATTTAGTGTTTTGTTTTTGTTTTTGTT
chr1:64731000-64731018
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chr1:64879490-64879508
ATAAAAAGTAATAAGTCATTAGTCAGTATA64879490GGCTAAGTTATTTTTGTAATAAACAACCAGAAAATCTTACTTCTCAGTA
chr1:70054295-70054313
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chr1:79691670-79691688
TACTTTTTTAATTCATTTTTGCCTTCATTT79691670GGCTGTGTAATTCTTTTAACTCCTAGGTTTGTGTTCCTCTGTGAATTCC
chr1:81277627-81277645
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chr1:89536018-89536036
TTTCCTCACTTTCGGTTCATTTGGTTTGCA89536018GGCTATGGAATTCTTCTAGTAGATGGTCACAGATCAAATTAATTCACAG
chr1:151770718-151770736
TGTCCAATATGGTAGCCATTGGCCACATGT151770718GGCTATTGAATGCTTGTAAAGGTAGGTGGTACAGCTGAGGAATGGAATT
chr1:157616970-157616988
ATATCCTAATGCAACATTAGTTGCTATTAA157616970GGTTATGTTATTATTGTAATACAAAATTTTTTAAGTTTTAGATTTAAAA
chr1:158230121-158230139
CACTTACCCTTGCTCAGAGTGGTGGTTCAG158230121GGCTATGTACTTGTTCTAAAATGACACTGTTTACATGACGCCTGATTCT
chr1:177514063-177514081
GTGTGTGTGTTGGAAGAAGATATTAATCCC177514063AGCTATGTGACTCTTGTAAGTCCAAAACTTCATCTCTCATACTTGAATG
chr1:177971197-177971215
AACTTACATGTCCTTCTCTAGACCTTGTCT177971197GGCTCTGTAATTCTTTGAAGTACATCAGATCATTGGGCTCCCATCACTC
chr1:186857005-186857023
GTGATGGTTATAGATTATGCAAAGAAACTG186857005AGCTATGTGATTATTGTAATCCAACTTTAAACTAGCCTCTTAAAACTTA
chr1:188070856-188070874
ATTTGGAAACTATGAGTATTATTATTTTAT188070856GGCAATGTAATTGTTTTAATCTGTTTTCTCTGTAACAGGGTACAATTGA
chr1:191286560-191286578
GAAGCATTGCAGAAGTTGAAAGCAAATCAA191286560GGATATGTGATTCTTGTTAATTAACAACAACCATTTTCCCCTACGACAT
chr1:194142596-194142614
GAAACTGCTGAACTTCATGATTCTAACAGC194142596TGCTGTGTAATTCTTGTATTTTTGTCATTCCTAAACTTCATAATCTGCA
chr1:215979886-215979904
TGCTAACCCCTTAAAGATGTCTATCAATCT215979886GGCTATGCATTTCTTGAAACTGTCCCAAAATCTACTAAAAAGAACAATA
chr1:224303523-224303541
TGATTGAATTGAACCATTCAACCAGACAAT224303523GGCTTTGTAAATCTTGGAATATTCACAGTTCTGTTTTGTAAGTGTTGAG
chr1:239921729-239921747
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chr2:24959574-24959592
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chr2:27076121-27076139
GGCGTGGCTGGTGAGGAGCTGTTGTCCCAA27076121GGCTATGTAATTCTTGGTGTGGGGAAGAGTCATCATGTTTGGTTGATGG
chr2:28536801-28536819
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chr2:35148148-35148166
AAAGAATTGTACAACTGTGATCACAGTCAA35148148GGCTATGAAATTCTGGTGACACCCAAAATTCCTTCATGAACCTTTACAG
chr2:38148772-38148790
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chr2:48332871-48332889
CTATAAGAAATCTAAAAATAAAAAATTGAC48332871TTCTATGTAATTCTTGTATAGCATCTTACAAGCTGCAAGGCATGCTTAA
chr2:54244814-54244832
CTTATAGATAGACGTAGTTCAGGAGTCAGT54244814GGCTCTGTAATTCTTATGAAAAATAGTATTCCTTTATCCCCATCTTGTA
chr2:56897891-56897909
TTTTCCTTGCTTATGAAGCTTAATTTGGCA56897891GAGTATGAAATTCTTGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
chr2:61025482-61025500
TGAATGCATGCTCAGTTTATTAAAATCCAT61025482AACCATGTAATTCTTGTAATATGTTGATTCAGTGTTTTGTAAATGAAGT
chr2:66596494-66596512
TAACTTTTCCCAGTCTTTGCGTAGCCCCCT66596494GGCTGTTTGATTCTTGTAATTATTTTGTCCTGTCACAAGGCAGTCTCCT
chr2:74354435-74354453
TAGTCTTTACTTAGTGACAGACTAATTTAC74354435AACTATGTAATTCTTTTAAGTTTGTAATTAAAATTTCTTCTGAATTATT
chr2:77457153-77457171
CTCTGAAAAACAAATAATACAGGAGAGCAA77457153GTCTGTGTTATTCTTGTAATTCCTCTAATTTTTCAGTGCCTAGCCACCT
chr2:78579537-78579555
ACAAAGATATTGAGCATGGTTAACATTTTG78579537TTCTATATAATTCTTGTAATTTTTCAGGATTTTATATATATATATACAT
chr2:82503891-82503909
CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCT82503891GGCCATGAAATTCTTGTAGTGTGTTTTTCAGACTTATCTGATCCATTAG
chr2:87370802-87370820
CTGGGACTACAGGTGTGCACCACTGCGTCT87370802GGCTAGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACCGGGTTTCACCATGTTG
chr2:102521482-102521500
CTAGAAGAGTTTCTGAGTCAAATTGTAAAT102521482GAATATGTAATTCTTCTAAATAGTGCCAAATCCCCCTCTGAAGTATTTT
chr2:107661398-107661416
AATATAACTTTGTTTAATTTTTCTCCAAAT107661398GGCTATATAATACTTGTATTGAAATAAATAAAACATGTTCCAATCTATT
chr2:117082354-117082372
TGAGAATTAAGAAGTGACCAAACCCTTCAG117082354GGCTATGTAACTTTTGTTATGGGCAAAGTTACCCAAGCAAACTCTGTGC
chr2:119827071-119827089
GTGTTATGTGTTTTAATAAAGATATTAAAG119827071GGCAATGTAATACTTGGAAACATTGAGCTCTGATGGGAAGGGCCAAATT
chr2:128868146-128868164
GTGCTGTCTCTTGGGGGAAACAAAATTGAT128868146GGCTTTGTAATTCTTTTAAAAAACTTTAATTTGCTACAACAATAATGCA
chr2:139627935-139627953
TGTTCATGTCATTTACCCACTTTTTAATGG139627935GGTTATGTTTTTCTTGTAAATTTGTTTGAGTTCTTTGTAGATTCTGGAT
chr2:140959368-140959386
CTCTGTGGGATGGCAATTTGGACTTGGCTC140959368GGCTATGTAGTTCTTCTAGTCTTAGCATTTGCTAGTTTGGCTGAGAGCT
chr2:141457940-141457958
TTTTCTTCTTTGATTATAGTCAAAAGCCAA141457940GGCTATGACATTCTTGAAATAACGTGGATTCTCATATGGCCTTATTGGG
chr2:142940813-142940831
TTTATTAGCAGCGTGAGGACAGATTAATAC142940813AGCTATGTACTTCATGTAATGGTACATTCCCAACCCTCCCATTCAACTA
chr2:143138166-143138184
GCCAACAGATGGCACCTTAGAAAAAGAGAT143138166GGCTATGTAACACTTGGAAAAGGAGAGAAACTGGGCTTCAATTTGAGGT
chr2:149544373-149544391
TGTGTCTAAAAAGTTAAAGATTCATAGCTA149544373GGAAATGAAATTCTTGTAATTTTTTTCTAAAGGAACTGTAAAGTTTTCA
chr2:153305199-153305217
TCAAAGCATTTGTTGAACTCCTATGCATTA153305199GGCTCTGTAATTCTCGTGAAGCCTTGCACCATTTTCAGCATTGAATTTA
chr2:155232450-155232468
GCAATGCATAACCTGGCATGTTCACTTAGA155232450GGTTTTGTAATTCTTTTAAAATACATTTTGTTGGAAGGACGTAGTTGTT

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/GGCTATGTAATTCTTGTAA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : GGCTATGTAATTCTTGTAA | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
6.482 | 6.472 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=GGCTATGTAATTCTTGTAA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
6.494 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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