GGGenome Help | Japanese

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2024-05-06 03:27:20, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:29657827-29657845
CATTTCAAAGTGAATAATGTGGCTGTCTTG29657827GGCTGTGTTTAATCTCTTAATGCATCCCTGTTTGAAGAGCAATGGGCTC
chr1:41370911-41370929
AGATGTGAGCCACCGCACCAGGCTTCCTGT41370911TGGTATTTTTAATCTATTATTTTGAAATGATTTTAGATTTACAGAAGAG
chr1:46371135-46371153
CGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAT46371135AGGCATGTTTAATCTTTTAAAAAATGAAAGAGCCGGCTGTGCGCGGTGG
chr1:60105753-60105771
GACATATGCCCAGTTGTATCTAAAAATCCT60105753GGGTATGTTTACTTTTTTAAAAAGTTGTATGTTTGTTCACATACCTCAT
chr1:68568916-68568934
TTCAAAGACGGTTGCTAGGGAAACCAGTGG68568916GGATATGTTTAATCTGTAAATCCTGTAATTGCCCTAAAGTAGCAACAAT
chr1:69841291-69841309
GATTATGAACACACAGTAAAAATGAAACCA69841291GAGTAGGTTTAATCTTTTAAAATATATACATATATATTTACTGTCACTT
chr1:71109342-71109360
ATAGCACCAAGTCAAATGACAATTTGTCAT71109342GGGTATGGTTAATCTGATCAATATAGGTGGACAACAGTATAATTCAAAA
chr1:77508973-77508991
CTAGAAATATTGCTCATTAAACATGAACAC77508973GGGAATGTTTAATTTGTTAGGACGTAGGTGTTTTGAAAGCAAATCATTG
chr1:83298989-83299007
AAAGTCATCTTATTTTTAAAGAGATTTTAA83298989TGGTATATTTAATTTGTTAGATGCCTTGCTGTCTAGATTATATTTTTTT
chr1:86596043-86596061
AACTAAATCTATCTACATTTGCTAATATTA86596043TGGTTTGTTTAATCTGTTGTATTATTTTATGTTTTACCACTTTAATTTT
chr1:98593315-98593333
AATACAATGTGAATTCTGCCTCATTGATGT98593315GAGTATGTGTAACCTGTTACTTATAAAGTGTCTGTGGTTTGAAAGAAGG
chr1:104661088-104661106
TTGGCACATGACCAAAAATCTAGTTTCCTT104661088GTCTATGTTTAATCTGTAACGTTGTACTAATCAGAGTGACATAAAATCA
chr1:163340894-163340912
CTTGGCCTACTATACACATTTCTTATCTAG163340894AGGTATGATTAATGTGTTATACCTTGCCTAACGCAGGACCTGTTGCATG
chr1:167735087-167735105
CATTTTTCTGATGGTTCATTTCCAAAATGA167735087GTGTATTTTTTATCTGTTATAGACTTCAAGGCCCTTCTTTTGCTTCAGG
chr1:170011208-170011226
AAGTTCAATGTGCCTAACGGGTGGAAAGGG170011208GGGTCTGTTTTATCTGTTTTGCTAGGTTAAAACTTGGATATTGAGCCAA
chr1:173863913-173863931
CACTTTATGGAAGGCATGTCCAGGACTTGG173863913GGCTATTTTTAATGTGTTAATGTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGT
chr1:190954707-190954725
GGTTCATCAGCCTGAAAATGCTGTAGTCTT190954707TGGTATGTGTCATCTGTTATTGACTTCTCTAATACCTTTGATTTAGACC
chr1:200654121-200654139
TAATTACTGATACAAATAGAGCTATATTTT200654121GGGGATGTTTATTATGTTAAAGATAATGTTATTCTGAAAACAATCTCTT
chr1:206804773-206804791
TCTACTCCCTGGGAACAGCTGCAAAGGATG206804773TGCTATGTTTAATCTATTACAGTACCCAAGGTTCCTAAGCTTTAATGCA
chr1:209194975-209194993
ACCTTGGATTTCTGCTTGAATAGATTTCTT209194975GGCTCTGTTTAATATGTTATGTTATTTGTGACTCCAAAATATTCTGTCT
chr1:213039917-213039935
TAAGATATCACGAAATCATACATGTGATGT213039917GTGTATGTTTAAACTGCTACAAATAAAAGATCTTTACTTGTTGAAGGAG
chr1:227234571-227234589
CCTTAAAAATCTTTCACTTGTACTTTCCTT227234571GGGTATCTTAAATGTGTTATTTCACTGCTGTTGTTTTTAGCATACTGTT
chr1:232002521-232002539
GTATGGATTCTTCTTTCAACCTTGACGAAA232002521GGGTATAATTAATCTGTAATTAAAGTCATGATAGTTTCTTAATACGAGG
chr1:232096651-232096669
AGAAATTGGGATTCCCATGATCCCCTCCTT232096651GGGTTTGATTAATTTGTTAGACTGGTTCATGAAATTCAGAAAAACACTT
chr1:234117458-234117476
CAGGAATGCAGTTTTTGGGTTGCGTAGTAA234117458GTGTATGTTTAATTTTTTAAGAAACTGCCAAAGTGTTTTTCAAAGTGGT
chr1:239751636-239751654
TAATGTATCTGAAAGTGCTTCTCTGTATGG239751636GGGTATTTTTATTTTGTTAACAAAGAATTTATGGAGCCCCAGGACGTAG
chr1:241495241-241495259
CAGCAGATACAGGAGGAAACCTGCTGGCCT241495241GGGAATGTTTAATTTGTAATGGACTAAGAGAACAATCGAGTTTCCAAAA
chr1:243613905-243613923
GTTTTAGTAGAGATATGAGTGGACAGCATA243613905GGGTATGTATAACCTGTTTATTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTATATAACC
chr2:5321852-5321870
GAAAATATGATAGTCCCCAGAATATAAAAT5321852AGGTAGGTTTAATATGTTAAAACAAACTGAGGAGGGTGCCAAAAATTAT
chr2:6651868-6651886
TCCACTTCCGATTATTTGGGACAATCAGTT6651868GCTTATGTTTAAGCTGTTAAACTGAATTCCCTGTTCGGATTAAATTTTC
chr2:21465960-21465978
AGTATACCTCCCATCATGGGCCCACTCTTG21465960GGGGAAGTTTTATCTGTTAGGGAGGTCACAAATATTTTAATTATTAGAG
chr2:30520532-30520550
GCAAGTAGGAGAACTTGAGCCATGTCAAGA30520532GGGTCTGTTTCATCTGTTGGAAAGGTTAGGCCAAATGCAACCCCTACAG
chr2:46708398-46708416
TTTTGATAGAACCATCACCTCCCCGATCAG46708398GGCTATGTTTATTCTGTTGGATCATACTGCCTTCTAGTCAACTGAAACA
chr2:48397168-48397186
TTATATAATTTATATTTTTTGTACCTTTCT48397168GGGTATGTGTAATATTTTACCAAAAACAACTTAAGAAATCACTAGAGTT
chr2:53227889-53227907
GAGATTGAGATGAATTATCAATTCATCAGG53227889GTGTATGTTTAATGTGATATACTTGCACTAATGGTATGTGCTTTTAATT
chr2:55442164-55442182
TCTTCGTATTTATGATGCTTGGGATTCTTT55442164GGGTTTGTTGAATCTGTGAATCAGTATCTTTCACATATTTTCAGTATTA
chr2:70923880-70923898
AAGCAAGAATAAACCTCTGAGTGGAAACAT70923880GGGTATATTTCATCAGTTATTATTAATGAAGAAGTTACTCGTCATTAAA
chr2:71510883-71510901
GTATCATTGAAATGAACAAATTTGTATTCT71510883GGGTATGTTTCATTTGCTAGGTTGCTTGCTTGTTTTAAGCAAATTGTTT
chr2:73343625-73343643
CAACTAACATAAATGTGTCACTCCTTCAGC73343625GGGTCTGTTTCATCTGTTTGCCTGTTCTCCAACGTTACTGCTCCTACCT
chr2:77065256-77065274
ATAAAAGAATGGAAGAAGAAGAAAAAATTG77065256GGGTATGTTCAAACTATTAGTACTATTTATATAAACAAGTCTCAAAAGT
chr2:87747876-87747894
AGTTTCTTAAAAAGGAAAAGGTAGGGGTAA87747876GGGGCTGTTTAATCTATTAATACTTCAGCCCACTCTCAGCACCCAAATA
chr2:104340656-104340674
CCACTTACTAGCCAGTCTATATATTTTAAG104340656TGGAATGTTTAATCTGTTACATTCAAGCTTATTATTGATATAGGAGGGC
chr2:105291819-105291837
ATTAAATTCATATTCTTACTGAAATGAACA105291819GGGTATTTTTGATTTGTTAAAAGCAGAATACAGTTTTGTTTTTTTTTAA
chr2:115614363-115614381
TTCTGTTTTTTATCTTAGCGGTGGCCATAT115614363GGGTATATTTACTTTGTTATAACTCACCTAGCTATATGCTTGTAATTTG
chr2:117103291-117103309
ATCTTGTATAATGTTTTATTTCATAAAGAT117103291GGGTATTTTTAATCTGTGTTGCTCCATGGTAGTCTAAAGAAGAAATCCC
chr2:126599318-126599336
TAGGTGTAGAATGGCCAGATCATATGGTAG126599318GTGTATGTTTAATCTTTTAGAGACAACTTGTGTCCCAAAGTGACTACCA
chr2:134620808-134620826
CTGACCCCCCACTTGCAGGATGTGCGAAAG134620808GGGTGTGTTTCATCTGTTTGGCCACAGTGTGCACTCAAACCCCTTACAG
chr2:141591383-141591401
GAACATGTTAGTGTACAAATTTTTTACAAA141591383GGTTATGTTTAATATGTTTTAAAGGGGTTAAAAAAATCCCTGAAACAAA
chr2:148072178-148072196
GTTCATGTCATCACCCCCTCACTGAGCCCT148072178GGGTATGTTTAATCATTGAGGGCCAGGAAATTGACTTCCTCCTGGACAC
chr2:151755563-151755581
AGCATATGGAATTTATTTTCCCTCACACCT151755563GGCTATATTTAATTTGTTATGAGAGGTTCCTGACTGTGTTATATGACCT

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/+/nogap/GGGTATGTTTAATCTGTTA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : + | nogap : true | query_string : GGGTATGTTTAATCTGTTA | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
5.937 | 5.926 | search_plus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=GGGTATGTTTAATCTGTTA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
5.948 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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