GGGenome Help | Japanese

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Search for: both strand plus strand minus strand

2024-05-19 04:24:52, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:41108706-41108724
CACTATGTATGCTACCGTGATATTCCATTG41108706TATAGAAGTAGCATAATTGATTTAAGTATTTCAGTAGAGTTACCGCTTA
chr1:41757786-41757804
ACTTTTTAATGGTTGCATAGCATTCTGTTT41757786TATGGAAGTAACATAATTTAGTCAATGGATTTCCTATTGAACATTTACA
chr1:42849032-42849050
GATCACCAATTCTGCTGTCCAAAGATTTGT42849032TATGGAAGTAGATTAATTAAAGCACAAGTGAGTCCCAGGAGAATGACCT
chr1:50040905-50040923
CATTGTCATCCTCCAGTTAAAGTAGGGGCT50040905TATGGAGGTCACATAATTAATGGAGTTTTAGCTCTGACTTACAGTGGGT
chr1:50515763-50515781
GGTTCCGGTCTGACCTCACCACTCAGTAGT50515763TATGTGACTTGCATAATTAATTTTTTGGTCCTTCCTGCCACTTTTTTCG
chr1:61893592-61893610
CCTTCAAATATTCAAACACTTTTCTGGTGA61893592ATTTGAAGTTGCATAATTACCTGTAAAGCATTAAAACAGAAGAACATAA
chr1:63420862-63420880
TTGCTCTCTTAGAACACTATTCATTTCCTT63420862TATGGAATTTTCATAATTTATAACTTATGTCTAACTGTTAAAATTTGTC
chr1:63878951-63878969
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chr1:69969543-69969561
ATAGTGATAGTAGAGAGCCTGTTTAGGACT69969543CAGGGAAGTTGAATAATTAAAGAAGTTGTGGTTCTAGAGCAAATGTCTT
chr1:77306275-77306293
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chr1:79598627-79598645
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chr1:81228966-81228984
GCGGTGATATTGAAGATAATAATCTACATA81228966TATTGAAGTTGCATTAATATATCATATTTCATAATAATCGTAAGAGGCC
chr1:82685932-82685950
TTCTGAAAAGTTGTGCACTTTGGATAGTGA82685932TCTGGAAGTTGCCTGATTAGTTGTCACCTCACAACAACAGCAGTAAAGG
chr1:84236402-84236420
TAGATATGAAAAAGGAAATAATCCTCCAAA84236402TATCGAAGTTGGATAAGTAATTTAACAACACAGTTTGGTTCAATGCACT
chr1:94101574-94101592
TCTCCGGCAGCCAGGGCACTTATTCTTGGC94101574ATTGGAATTTGCATAATTACTCCTTTTTAAATATGCTGGGTGACCTAAT
chr1:96886896-96886914
TAAAAACTCCCTGCACTTAGATTTAATTTA96886896TATGTAAGTTACATTATTAAAAGTCATAAGGCATTTATCTGAGTCATTG
chr1:103290531-103290549
TAAACACCTAGGTATGCAGTTTCTGGGTTT103290531TATGGTAGTTGCATGTTTAATTTTTGTTTGAGAAACTGACAAACTGTTT
chr1:105426771-105426789
CATGTTAGTGGCAAAGTAATTATTTAAAAC105426771TATGAAAGTTGATTAATTAGGGAGGAGAGTATTAGGACATCTTAAGTTG
chr1:111716534-111716552
TCTTTTTAAAAGCTGTAAAATATTCTATTT111716534TATGGAAGTACCATAATTTATATAACTATTCCCTCTGAGGGAATTTTTT
chr1:118586665-118586683
AAAATGCTATCTGGAATTTATGGGTAGCTA118586665TATGGAATTTACATAAATAATATTATATGCTTTATTATTATATGTAAAT
chr1:146718097-146718115
TAAATGCCTAGGAGTGCTGTGAGTGGGTCA146718097TATGGTAGTTGCATGTTTAGTTTTTAAAGAAGCTGCCAAACTGTTTCCA
chr1:152600579-152600597
TCTAAGCAATGATGAACTGAGAATTGTCTT152600579TATGGAAGGTGTTTAATTAATCTTTGCTGAATTAAACTCACAGCTCTGA
chr1:155327026-155327044
GGCTTAAGACAAAAGAAAGTGGATCAACAA155327026TATAGAAGTTTCATAATTTTTTACACAGATAAGCAATCATGTAACTTAC
chr1:159936291-159936309
TATATTCTCAGAAGTGGGATAGTTGGATCA159936291TATGGAAGTTACATTTTTAGTTTTTTGAGGAACCTCCATACTGTTTTCC
chr1:171139321-171139339
TCATAAATACTCATGATTCCTCCTATAGCA171139321TATTGAATTTGCATATTTAGCCACCCTGCTCAACATAAATTCATGTTCC
chr1:173327127-173327145
GTTCATGTCCTAATCCCCAGAACCTGTAAC173327127TATGTAAGTTGCATGATAAAGGAATCTGCAAACATGATTAAGTTAAGGA
chr1:177427934-177427952
AGCTTTTACCTCACAGGCCAAGGACCAAAA177427934TATGGAGGTTCCACAATTATCAGATATTTCTAGCTTATTTATACTTTTG
chr1:180487813-180487831
TGAAAAGACTTGGTGAAAAAAATCACTTTG180487813TATGGAAGGTGAATAATCAGCAAGAATTTATTGACAATTGCCCACATGT
chr1:185957531-185957549
CAAATACAAAGTAATGACATGCTAATGAAG185957531TATGGCATTTGTATAATTAGCACTACTAGTGTTTTGCCATACCATCTAG
chr1:186114387-186114405
CTAGTCAAAACCGAAGCTAAACTATCTTCC186114387TTTGGAAGTTGCCTATTTATAGACTTGCATGTTTTGTTTTAGGTGCTGA
chr1:190678836-190678854
TAAATGCCCAAGAGTTCAATAGGTAAGCCT190678836TATGGAAGTTGGATGTTTAGTTTTATAAGACATGACTACAATATTTTAC
chr1:191433533-191433551
CAATAAAGAGAATATAAGGAGTACTTATAG191433533TATGGAAGGTGCAGATTTAAAGATCAATATCATTAGACAAACTTGGTGA
chr1:193663808-193663826
GTAAATTGACATAGCCATTATGGAAAAAAC193663808TATGGAAGTTCCATAAAAAATTAAAAATAGAACTACCCTATGATCTAAC
chr1:195071733-195071751
CCAATCAGTACTTTTGACCTTAGAAAAATC195071733TTTGGAGGTTGCATAATGAAGTCTATTATAAAATGTACAAGTTAAAAGG
chr1:196557849-196557867
CATGTTAGAAACTTATATTTTACAATGATT196557849TATAGAAGTTGTATAGTTATGGGCAGCAATTAATTTTTACCAAGGAACA
chr1:202399262-202399280
AAAACTTTTACTGAAATAAGTTTAGACTCA202399262CATGGAAGTTGCAAAAATAGAGAGTTCCTGTGTATTCTGTACCTAGCAT
chr1:202580940-202580958
AGGGCACTAAGATTTACTCCTTTGTTTTCT202580940TATGGGAGTTGCATAGTTTTAGCTCTCACATTCAAGTCTACAAGCCACT
chr1:207399418-207399436
CAGCACTTAGAAATTTACACTTTACTTATT207399418TATTTAATTTGCATAATTAATATATACACATGGTACAATATTTTAATAG
chr1:209091468-209091486
GTTTTATTTTTTTGTATTCTGTCTGAAGAA209091468GATGGAATTTGCATAATTAAGAATGACCTGAGCAATCTCTGCTAATGCC
chr1:210580933-210580951
TAGAAGCGTTGTCTTCTGCAATGTAAAGCA210580933TGTGAAATTTGCATAATTAGTCACGAACAGGTAAAAATTTGCCTCTGTG
chr1:210921896-210921914
AAAAAGAACCAATATTCAACGTTATGGTAC210921896TATGGAAGCTACATAATCATAATAATAACTCTATCAAAATACATTGCTC
chr1:211831781-211831799
TTTGTGCAAGCATAAACATTCATATATACT211831781AATGAAAGTTGCATAATTATATCAGTAATGAACAGACAAGCCATATTCA
chr1:217048617-217048635
TTTTATATAGAAAAGTGCACAGATCTTGCT217048617TTTAGAAGTTGAATAATTATCCCAAAGTGAACACACTTTTTATCCATTA
chr1:217872585-217872603
TAAATACCCAAGGGTGCAAGTATTGGGGCC217872585TATGGTAATTGCATATTTAGTTCTACAGGGAACTGTAAAACTGTTTTCC
chr1:221812911-221812929
AAATCACAAATGCAGTTAAGCTCCTGAATA221812911TAAGGATGTTGCATTATTAGGAAGTTAATTATATGTGTTATATGACTAG
chr1:226226556-226226574
TAGATGCCCAGGAGTGTAATTGCTGCATCA226226556TATGGCAGGTGCATATTTAATATTGTAAGAAGCAGTCATATTCTTTGCT
chr1:236812019-236812037
TCTACAAGAATTACCATAAGTAATGGGAAT236812019CATGGAACTTGAATAATTAATTTATTTTGTTAAAGAAAGCACAACAGAA
chr1:241246819-241246837
TCCGCAGCTCGATTGGCTATGTAGTTATTA241246819TGTGCAAGTTGCATAGTTACTCAGTTCTGTCAGAGAGGATGTGTGAAGA
chr1:244071009-244071027
CTGTATACCAGTAGTAAGTTGTGCAAACCT244071009TCTGGAAGTTGTATAAGTACCTTGACTTAAGGGAAAATAACTAGAGTGT
chr1:245084316-245084334
ACTGTGTTCATCTGTCTGGTTTTATATATG245084316TTTGGAAATTGCATAATAAAAAGTCTAAAATTTATTTTAAAGTACAGAT

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/hg19/3/-/nogap/TAATTATGCAACTTCCATA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : - | nogap : true | query_string : TAATTATGCAACTTCCATA | format : html | download : | debug : 

0.012 | 0.012 | search_start;
7.620 | 7.607 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=TATGGAAGTTGCATAATTA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
7.631 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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