GGGenome Help | Japanese

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Search for: both strand plus strand minus strand

2024-05-02 22:56:00, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:4944267-4944285
TGAACCAGGCAGTCTGATTCCCATGTCCAA4944267GTTCTTAACCACTATGCTAGACTTCCTCTCAGTAAAAGGGCTTCATAAA
chr1:8292767-8292785
CTGCTGATAATCCCCTTTTCCTCCGTGTGG8292767GTTCTTAACAATAATGATGATATCTAACATTTCCGAAGCGGTTCCTCTG
chr1:10257038-10257056
AAGTGAGGGGAATAAAAATCAAGTTTCTTA10257038GTTCTTACCAATTTTCCTTTTGACCAAATCAAGGACAGAGTTCCAGTTG
chr1:11470381-11470399
ATGTTTATTTACCATTCTGAGAATCCTAGA11470381GCTCTTAAGAATTATGCTAAGTAGGCCGGGTGCAGTGCCTCATGCCTGT
chr1:12053352-12053370
TTATTCCACTTACATGAATTTAATACACGT12053352GTTCTTAACAATTGTGCTTGTATTGTTCATGAAAATTTCGTAAGACATT
chr1:15241749-15241767
ATGTGTAAACTGCTCTGTCTACTATTAATA15241749GCTCTTAACAATCATGATTATATATCTGTGCATTGATTAATTAAATGGT
chr1:18835639-18835657
GATTGTATTATCATGTGACATAGCTTGGGT18835639TTTCTTTACATTTATGCTTTTGGAGGCAGTTCATTGAGCTTTGGATCTG
chr1:25684742-25684760
ACGGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCAAGA25684742GTTCTTAACCTTTATTCTTTCAGTAGTCTTCTGAAGGTGAGGTATCACC
chr1:29634245-29634263
GTTTTTTGGTGGAAGCAGTTTGGATAGTCT29634245GTTTTTAAATATTATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGG
chr1:35489107-35489125
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chr1:36424948-36424966
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chr1:39869386-39869404
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chr1:39901115-39901133
ACACAAATGGTGAGATGCTGGGCCTTGCTG39901115GTTTTTAACAATTTTGTTTGTTCCTCTTAAAGTTGATATTAGCTCTGAT
chr1:43550335-43550353
TATCCAAGTTATAGCTATTTAGATCACTTT43550335TTTTTTAACAATTATGCCTAGAATACTCATGAAAATTAAATGAGACATT
chr1:46273200-46273218
TAACATTTCCACCGTAGACTCATCATTTGT46273200GTTCTTAACATTTGTGATTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTT
chr1:50593493-50593511
AAACCTGGGCAGTCAAGCTCTAGTGACTGT50593493TTTCTTAACTATTATGCTATGCAATTAGTATTTAATAAATGTTTGAATT
chr1:50914563-50914581
AAATCCCAAAAACCTCAGAGCACTAAGCAA50914563GTACTTAACAATTAGGTTTTGATGTAACATGATACGAGGGTCACAGCTT
chr1:51006128-51006146
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chr1:56330061-56330079
ATGCTTATTTACCATTTAAAAAATCTTGGT56330061GTCCTTAAGAATTATGCTAAATCTCCTCCGCCTGTGCTCTGTCAATAGA
chr1:65710792-65710810
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chr1:67026501-67026519
TTATGCCACTAACTGTGTGACCTTAGGCAA67026501GTTCTTAAGCTTTATGCTTTGGTTTCCTTTTCTGTGAAATGAGGATAAG
chr1:67816324-67816342
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chr1:68964275-68964293
AGTTTCTTTAAGGTAACTTTACATACCTTT68964275GCTCTTAACAATTATTCATTGATTGCATAGTTTAAATCTTGGAAGTCAT
chr1:69194927-69194945
AAAATCATGTGCTGTATTTATTTGTCCCTT69194927ATTCTTAAAAATTATGATTTTCTGGGTGCAAAAGTAGGACTTGATAGCC
chr1:70430105-70430123
ATCTGAACTCAGTCCACCTCCTGAGATCAT70430105GCTCTTAACCATTATGCATACTGCCTGTCCAGGGATGCTACCCCACTCA
chr1:70664293-70664311
TTACATGTACAGTATTTTTCTTTGAAGTTG70664293GTTATTAACAATTATTCCTATTTGAGAATATCTTTCTAAATAAGTTATA
chr1:70946611-70946629
TTAAAGATAAAATTATAGAACATTTGAGGT70946611GTTCTTTAAAATTATGCGTTGGTATTTACATTTTTAACATGCTACCATA
chr1:71557438-71557456
GCTTTGGCTTTGATTTAGGAAGCAAAACTT71557438CTTCTTAGCAATTATCCTTTTATGTTGCAATTACCTATTTGTTTTTATG
chr1:72163175-72163193
GGTTCTGCAGGTATCCAATTTATATTCTAA72163175CTTCTTAACAACAATGCTTATGGAAAAATTCTTTCTTCACTTTCTTTTT
chr1:77154889-77154907
TCAGGCAGTCTGTCTCTAGAGTGTGTGTGT77154889GCTCTTAACCATTATGCTATATTACCTTCAGTGCAAGTTTCACTTGATT
chr1:77836651-77836669
ATACTTTGTTCTACAGCTTCTTTTGAAGTC77836651TTTCTTACCAGTTATGCTTTCTTCTTTCTAAATCATTTATGTGTGGCTG
chr1:79223265-79223283
GCTACCAGACCATGTTCCTACATATAGTAG79223265GTTCTTAACAAATATGCATAATCAAATTAAAATTGTTGCGTGAGTTTTC
chr1:81652343-81652361
GTTCCAAAAACAAACAGAAACTTACTGCGG81652343GTTCTTAACATCTATCCTTCCATTCATTGAGACAGCAAGTCCTAGAGAG
chr1:83167291-83167309
GTTCTTAAGGCTCTACTCATCTTAATGAGC83167291CTTCTTAACAACTATGATTGATGGATTACACTTGTTAAACACTTAATAT
chr1:84682624-84682642
CAAGATTTTCATGAATTTTACGTGTATCAT84682624CTTCTTAACTTTTATGCTTTGAGCATTTTGGGAGTAGGAAGACTCTGTC
chr1:89341320-89341338
GAATCATTTTCTCTCCATAAATCCTTACTC89341320ATTCTTAAAAACTATGCTTCACTCGAAATTCAACAGTACTATCTTCAGG
chr1:90747019-90747037
GAGCACAGATGGTTGACTTCCAAAGCCTAT90747019GTTCTTAACCATTATGCCACTCTGTGTTGTGACAGCGCCAAACATACTT
chr1:92769105-92769123
GCAGTAACAATGACACTTTTGAAATACTTT92769105GTTTTTAAAGATTATGCTTTAAAAAATAGGTAAAATTATATTTTATTAT
chr1:92995435-92995453
ATAAATCAATGGGCATATTTTCATAAATAC92995435TTTCATAAAAATTATGCTTACTGTATTTTCATAAATACTTTCATAAATA
chr1:93876075-93876093
TATTTTTTCCTTCAGATGAGATATTTATTC93876075ATTCTTATCAATTATGCTTGAACAGTTTCTTAAACAAAGCTAGCCATGA
chr1:94004390-94004408
TATTTGCTGCACATTGCTTTTCCTAAATAA94004390CTTCTTAAAAATTATGATTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTTAAAGAAA
chr1:97805351-97805369
ACTAAGACAGAATAGAAATTATAAGACAGT97805351GTTCTTAAAATTTATGTTTGTGTGTGTGTTTAATTAAAACCCGTAACAA
chr1:99856459-99856477
CTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAATCCTAGA99856459GCTCTTAAGAATTATGCTAAATCTACTTTGCCTGTGCTCTATAAATGGA
chr1:103016833-103016851
TCTTTTCTATCATATCATCAGGCTGCAAAT103016833GTTCTGAACTTTTATGCTTTGCTTCCTTTGTTTTTAAATTATACTTTAA
chr1:103037653-103037671
AAAGTCATATCTATTAACTCTCACAGTTGA103037653GTTCTTCACAAATATCCTTAATGTCTTACTTCTCAAGGCTTAGTTTTTC
chr1:104770303-104770321
TAAGAGACTTTGCAATAATCTTTTTGACAG104770303GTTATTCACAAATATGCTTCCTCTCTTTTTTCTGACAATATAGTAAAAT
chr1:109222342-109222360
CTGCTCTTTCCTTTTTGTATTGCCGTAATA109222342GGTTTTAACAATGATGCTTCAGGTCTGTTATTGCCAGACATTGCCAGCA
chr1:111294118-111294136
TCTTTATCCTTTTTTTCTTTGTTTGCATTT111294118GTTCTTGAAAATTCTGCTTTCCTCAGGCATTAGAGGGGCCCAGGGACAT
chr1:111713013-111713031
CCATATAGTCATTCATGTGGTAGGTAATGT111713013GTTTTTAATAATTAAGCTTAATTTCAAAAATAGACTTGTCTTGCTGTCT
chr1:116176102-116176120
TCACTGGAGAAAAATGGACAGTAAATGGCA116176102TTTTTTAAAAATTATGCTTCAAGTTCTGGGATACATGTGCAGAACGTGC

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/-/nogap/AAGCATAATTGTTAAGAAC
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : - | nogap : true | query_string : AAGCATAATTGTTAAGAAC | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
7.095 | 7.086 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=GTTCTTAACAATTATGCTT&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
7.107 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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