GGGenome Help | Japanese

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2024-05-04 02:10:15, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:7243967-7243985
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chr1:30247372-30247390
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chr1:47517418-47517436
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chr1:47521573-47521591
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chr1:48140007-48140025
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chr1:51467436-51467454
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chr1:88802682-88802700
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chr1:92334775-92334793
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chr1:93098212-93098230
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chr1:94975527-94975545
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chr1:98587767-98587785
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chr1:99806491-99806509
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CTCCTGGATTCAATGACTTTTTGAAGGGTT101131515TTTTATGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATCTTAGTTATTTCTT
chr1:106215387-106215405
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chr1:112017189-112017207
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chr1:116503606-116503624
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chr1:117350338-117350356
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chr1:119057386-119057404
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ATGGGAATTGTTCAGCTGTCCCTGGAAGAT120020053TATGATGGCAGTATTTCGTAGGATGGACTGAAAGAGATGCTGAGGATAC
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TCCTGGATTCAGTAATTTTTTTGAAGGGTT152234705TTTTATGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGTGATTTCTT
chr1:159443819-159443837
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chr1:170090565-170090583
TAACCAGAATCATCTTGATAAAATACATTA170090565TATAATGTCACTCTTTCATAATCCTGCACAGTTAACTGTGATGCTTAAT
chr1:171447467-171447485
GGTTATTTTTCTGTGTCAACTTGGCTGGGC171447467TACTATGTCAATATTTGGTCAAACATTATCCTGAATGTTTCTATAAAAG
chr1:172505596-172505614
ATGACAGATCTTTGTAACACAGTAACAGCG172505596TATTATGTAAATATTTCATCATAACATTATTCAACCACATTTTGTTCTC
chr1:173041222-173041240
CTCCTGGATTCATTGATTTTTTGAAGGGTT173041222TTTTATGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATCTTAGTTATTTCTT
chr1:177985481-177985499
TGTCAGTGAAGTATTGAAGTCCCCCATTAT177985481TATTGTGTCACTATGTCATTTCTTAGGTCTAGTAGTAATTGCTTTATAA
chr1:184372731-184372749
CATTTGCTTTTATACATTAAATTATACATG184372731TATTATGTGATTATTTCATAACAAAAGAGAAACAAAACAACAAAAACAA
chr1:187993531-187993549
CTCCAAATATATATCTCATGTTTTGAAAAT187993531TATTAAGAAACTATTTCGTGTGTAAGTTTTGTGAAATTGATTTATGTGT
chr1:191704371-191704389
GTTTCGTCCAACCCTACTTATTACTATTAT191704371TATTATTTCATTATTTTGTATGTGTGCATGAATGTGTGTGTATTAGGAA
chr1:192999783-192999801
TTTTTAAATTACAGCTTAGTCCTACTACAG192999783TATTATGTTACTATATTGTAATTAGTCTTTCCAATAATGCTAATTAGCT
chr1:194077161-194077179
GGTTTTAACCCATATCAAGAAAAGGAGGTA194077161TATTATGCCACTATTTGCTACCAATTTTTAATAGAAAATACGAGTAAGA
chr1:198178112-198178130
TTCCTTCAGCCCTCAGATACTCTGGACCGC198178112TAATATGTCTCTATTTCATTAGCTCTCTGATGCATTAAAGCATATATGT
chr1:199549019-199549037
ATTACATATTTGAATTACTACTGTCTTGTA199549019TAGTTTGCCACTATTTCGTCCTATGTTTTTCAGTGCAGTAGCAATTTTT
chr1:207833971-207833989
CTCCTGGATCCATTGATTTTTTGAAGGGTT207833971TTTTATGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATCTTAGTTATTTCTT
chr1:208402636-208402654
ACACACTACATTGCAGCATTGAGCTGTCTT208402636TTTTATGTGACTATTTCCTATCTCCCCACTGAATTAGAGGCTCTTTGAA
chr1:214272246-214272264
ATGTTTCTTAGAAACTTCTCAAGGACAATC214272246TATTATGGCACTATATTGTCAGACTCACTGGTGTAAAGTTTCCCTAATC
chr1:214729283-214729301
TTTCTGTTGTGTAAGCTACATAGCCTGTGG214729283TATTTTGTTACTGTTTCGTTATTGCAGCTCAGTCAGACTAATACACCGA
chr1:225159124-225159142
TGACAGAGAAATTAATTATTGAATAAATGT225159124TATCATGTCCCTATTTTGTTTCACTGGTGTAAGAACTGGAGATAGAACT
chr1:236230818-236230836
GTTACCTAAATGTACAGTTTTCGTGATTCT236230818TATTATGTCAATATTTACTGAGAATCTACCATGAGCCAGATTCTATACT
chr1:247834829-247834847
GTACTCACTGGTTTAAAAGGACTGGAGTAA247834829TATTCTGTCACTTTTTCCTGAACACATGGAGACTTTAGAGTTTGCCCAA
chr2:29874-29892
GGACATCTGATGGGAAAAAGTTCACATTTC29874TATTATGTCAGTATGTCATGGCTGGGCTGAATTAGGTGATCTCCAGGGT
chr2:5447981-5447999
AGTTGGCAGTTAATTTTAGCCTACTGAAGA5447981TATTATGTAACTATTTTCTGGTTTTCACTGTTTAGAAAATTTTTTTTTG
chr2:19775498-19775516
ATCATTATTTTCAGCCATATATGATTTAGA19775498TATTATGTCATTAATTCATGTACAGTCCATCTGAGTAATGATTGTGGTT
chr2:23670524-23670542
GGCTCCCCTGAGTCTCAGTGTCTAAACCGT23670524TATTGTGTCATTATTTCTTATCCGAAGGGCCCATATCCCTTAGCCAAAA
chr2:27366730-27366748
AGAGTTTGTGAAGGGTTGGTATTAATTCTT27366730TATTATTTCAATATTTGGTAGAATTCACCAGTGAAGCCATTTGGTTCTG
chr2:35040352-35040370
CAGGTAGTGTGGCAGGGAGAGATAAAGACT35040352TCTTGTGTCACTAGTTCGTGGGAAATTTCACATAAGCTTTTGGATTCTA

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/-/nogap/ACGAAATAGTGACATAATA
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : - | nogap : true | query_string : ACGAAATAGTGACATAATA | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
5.859 | 5.849 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=TATTATGTCACTATTTCGT&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
5.871 | 0.011 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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