GGGenome Help | Japanese

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2024-05-07 21:33:43, GGGenome : Human genome, GRCh37/hg19 (Feb, 2009)

Summary:

Results:

Matches are highlighted with blue background. Mismatches and indels are marked in red.

chr1:14297195-14297213
TGACCAAAATGTCAAAACATCTCTTTTCCA14297195GAGCCAATGCCTATTCTTAACAATGACTTTCTTTGGGAGACTATAGGCT
chr1:16662391-16662409
CGCCAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTTGACT16662391GTTTTAAGGCCTATTCTTTAAAATTCAAGGTTTTTAAATTTTGTTTTGT
chr1:75874593-75874611
AGGTACTGTCACTTAATAGGTACTTGTTGA75874593ATGTTAATGCCTTTCCTTACAGACCAAAGAAGTTCTGAAAGATGGTGCT
chr1:75994598-75994616
CTTGGTCTGTCTATTGCTTATTCATCTTTC75994598ATGTAAATGCCTCTTCTTACCTGACTCAAGTAAAAATTAAGCAACTCGC
chr1:78650420-78650438
CAGGATTCTGTCCTTTTTGTATAGGGGAGT78650420GTGTTATTGCCTATTATTAACAATGCTACTTTTGCCAGTCAATCATGTA
chr1:84667185-84667203
ATTTAAACATATGAATCAAAAAGTTAAAGA84667185GAGTTAATGCCTATTTCTATTAAAAAACAAAGTGCTATTCCTGTTATAC
chr1:90310942-90310960
CGTAAGTTTGAATTTAATTGTGAGATGGCT90310942GTGTTTATGCCTCTTCTTGCCAAATACGTCATGAAAAGTGAGAAAGTAA
chr1:91225002-91225020
AAAGCACATTACCAGGAAATTGTTTCTACT91225002GTGTTTATGACTGTTCTTAATGTTTTATGAATATGCTAAAAAAAATGCT
chr1:94651833-94651851
GCACCATGCCAATACATTTTACATCCAGTA94651833GTTTTGCTGCCTATTCTTATATTTGTATTTGTAACATTTGATTAATACA
chr1:98918576-98918594
TGTAAAGAACAGATTCACTAGAAAGCAAAT98918576ATGTTCATGCCTCTTCTTAGTTACTTTATTCCTACATTGATAGAAAATG
chr1:100510413-100510431
TATTTCTGGGTTATCTGTTGTGTTCCATTG100510413GTCTTCATGCCTATTTTTATACCAGTACCATGCGGTTTTGGTAACTGTA
chr1:119228844-119228862
ACATTTGGCTTCCAAATGTTTTTTAATTCA119228844CTGTGATTGCCTATTCTTAATGTATACATTATTTAGAAGTGTGATTTTT
chr1:142835484-142835502
AGGCTTATTTTTAGATTGTCAATTCTTAGC142835484TTGTTTATGTCTATTCTTATGTCAAGGCCCAATCGAATTGAATGAGAAG
chr1:143387199-143387217
AGGCTTATTTTTAGATTGTCAATTCTTAGC143387199TTGTTTATGTCTATTCTTATGTCAAGGCCCAATCGAATTGAATGAGAAG
chr1:156823270-156823288
CCCCACACTGCTTCTTGCGCTGCCTACTCT156823270CTGTTCATGCCTATTCTTTTCCCCCCATGCCCACCTTGAACCTGTCCTT
chr1:165811230-165811248
GTGTTGTCGCAGGTGGAGAGGAGTCAGAAA165811230GTGTTAATGACTATGCTAAAGCTTTTCTTGCTAAAGTCACCAGTAATCA
chr1:172539063-172539081
TTTTTATGAATTTTTAAAATATTCTCTCAA172539063GTGTTAAAACCTATTCTTTTCTAGAAGACAGCTTATTGCTTTGGAGATC
chr1:181578280-181578298
CAGGGCTACCTCCCGCCAGTCTCTACCTTT181578280GTTGTAATGCCAATTCTTATTTAATGTCTGCCAAACACAAAAGGTCCAT
chr1:186590543-186590561
CCATCCTCACAGGTTCCAGCTTGTGCTTGT186590543GGGTTCCTGCCTATTCTTAATCTCCTGACTTTACAGGCATCTTCCCTTC
chr1:190797744-190797762
CATTGAATCTGTAAATAAAATTGTTCTAAA190797744TTTTTAATGCCTATTTTTATAAACAGCTATCCTCAGGAAAGAAATGAAA
chr1:196634228-196634246
TTTTATCTCTTTTAATTATTGGTAATGGTC196634228ACGTTAATGCCTGTTCTTAAGTAAATGATCTATCCTACTCTAACATTTT
chr1:205336060-205336078
GCATGAGCCACCAGACCTGGCCCCACATAT205336060GTATTAATACCTATTTTTAATCTCAAAATAACTGACCCAGAAGCCTCAA
chr1:210011781-210011799
GTATAGAGAATGCACTAGAAATGTAATGAT210011781GTGTTAATCCTTTTTCTTACCCGCTTTATTTCTTCTCTACTTGTTCCAT
chr1:210581517-210581535
TAATGTGGTTTGACAGGTTAATACTATAAA210581517GTGTTAATTCTTACTCTTATTATTATTTGAGACAGAGTCTGGCTCAGTT
chr1:228687531-228687549
TAACTTGAAAGTTAATAAGACTTGAATGTT228687531GTGTTAATGGCTATTTTAATATTTTAATGGACTTAAAATAGTAAACCAT
chr1:237902101-237902119
CACCTCTGTGTTTTTGCTAATGTGAACAGG237902101GATTGAATGCCTATTCTTATCCATTTCACCTATCTTACAAGAGCTACAG
chr1:240569995-240570013
TCATGGCTCTAGTTTGAATTTTCTTCATGG240569995GTGTTAATGCAAATTCTCAAAAGGGTGAATGTGGTTGGTTCCTAGATAG
chr1:242021292-242021310
AAGATACAAAACTACAGGATGTTCTCATTT242021292TTGTTAATGCCTATATTTATGACTAGAAGGGTCTCTATCAAAAGGTTAA
chr2:5542659-5542677
GTGGGTCCAGTTTCCCCTCTCACTGCCTGT5542659TTGTTAAAGCCTATTATTAGATCTCTCTACATCTTTTCTCTGATAAGTA
chr2:11762109-11762127
TAAAGACAGGATTTGAACCCAGTTTGTTCA11762109GTGTTAAAGCCCATTCTTTAAATCTTATCTCTTTTGTTGAATAGGGATA
chr2:14620055-14620073
AGATTTCTCTCATGATGCTTAGGCCTACAT14620055GTGTGACTGCCTATACTTACTGGACATGTTCCTTGATGCCCAGAACCTT
chr2:22582382-22582400
GATGCCCGTGTATCTTGCCCCCACATGAAG22582382GTGTTAATGACTATTCCAAAGACCTATCAAGGAGTGTAGTCCTCTGGTA
chr2:32444824-32444842
TGCGCCCGGCCAGGACTTCTTTATATATTG32444824GTATTATTGCTTATTCTTACCAAGTATGCCATACATTTTCATTGCTTTT
chr2:51232372-51232390
CAATTAGTTTACCTTTACCCTGATTACTCA51232372GTTATAATGCCTATTCTTACTTCCCAAGAAAAAAATCTACACATTTTTA
chr2:54804215-54804233
ATGCAAGTTTTTTTTCCCCTTCCATTTCAT54804215TTGTTAATGCTTATTATTAGTTGGGGGTTTTGCCTCCTTTTTGTTAGCC
chr2:55624835-55624853
TTTCCTTTAAAGTGATTTTTTTCAAAAAAA55624835GTGTTAATGCTTCTTCTTAAATTTTGTGTCCAATATTCCTCACATGATA
chr2:57250767-57250785
TTAACTGTGTGGCTTTTGGAAGTCTTCTTG57250767GTATTAATTTCTATTCTTATTCCACTGTGTTCTGAGAGTATGGTTTGTG
chr2:70653810-70653828
ATCCTTGTAGGTCTGGAATAAGCCCTGCTG70653810GTTGTAATGCCTTTTCTTATAATACACTTCAAATTAAAAACCTAAAATT
chr2:71533388-71533406
CCTCAACAATACTCATTATCTTTTGTCTTT71533388GTGATAATGGCTATTCTAACTGGAGTGAGGTGATATCTCATTGTAGTTT
chr2:82326159-82326177
GGAAGGAAGCTAAACATCTGATTTTGGGGT82326159CTGTTAATTCCTATTCTTTAAGCACCACAGGCTTTACCAATTATGAAGG
chr2:82965077-82965095
AAATTTTAGTTAAGGAAGAATAGTTAGAGG82965077GTGATAAGGCCTATTCATAAGTAGAGTCATAAGGTCAATTCATACGTAG
chr2:99295130-99295148
GTTTATATGCTCTTATTATTTGTAAGAATG99295130CTGTTAATGCCTATTATTATTATGCTCTTATTATTGGTAAAAATGTGAG
chr2:99744975-99744993
TACTGAATTTAAGAATCATCTGGGAATGTT99744975GTGTGAATGCAGATTCTTATTTACAGGCTGAGATTTGACATTTCTATAA
chr2:100592546-100592564
TTTCTACAATGCTCACAGCATTGCAAGGAG100592546GAGTTAACGCCAATTCTTATTCAAAATTAAATTCTATTAGATATTAAGG
chr2:107736799-107736817
ATAAAAGTCCAATCTGTCTAAATTTTTTAT107736799GTGTTAATTCTTATTTTTAAATTTTATTTAAGACATATTTGACTACACT
chr2:111192532-111192550
TGGAAAATATTAAAACTCTGGGAATAAAGC111192532GTGTTAATGCCTGTTCCTGGTTGCATATCTGCCAGTGGGGAGAATGCAT
chr2:123716199-123716217
AAGGAGTTTTCCTTTTTTCTGCATAATCTA123716199GTTTTAATTCCTATTCATATATGTTATTATATAAACACGGTGTATACGG
chr2:126557462-126557480
AAAACTACAATAAGATATTACCTCATATCT126557462GTTTTAATGACTATTATTAAAAAGAAGAAAATAGATAAATGCTGACAAA
chr2:136319992-136320010
AAAGTTGAGTATTAGATGATATGACTTATT136319992CTGTCAATGCCAATTCTTAATTATTTGGTCGCTTATTATTTTTTTCTAG
chr2:137030171-137030189
ACTGGTAAGTTCTACCAAACATTTAAAGAA137030171GGGTTAATGCCAATTCTTCTCCAACTCTTACACAAAAATTGAAGAGGAA

Data Export:

Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/3/-/nogap/TAAGAATAGGCATTAACAC
lang : en | db : hg19 | k : 3 | strand : - | nogap : true | query_string : TAAGAATAGGCATTAACAC | format : html | download : | debug : 

0.010 | 0.010 | search_start;
5.968 | 5.958 | search_minus_done; http://172.18.8.78:28018/match?q=GTGTTAATGCCTATTCTTA&k=3&no_gap=1&offset=0&limit=50
5.980 | 0.012 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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