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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2021-01-18 19:43:52, GGGenome : Aspergillus fumigatus (Af293) genome, s03-m05-r06 (Apr, 2016)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Chr5_A_fumigatus_Af293 (3948441 nucleotides)
position: 2700862-2700876
CACCTCAGAACCGGCCTGGGTGAAACGGAA2700862AATGTTGTCAATGAAGAGCAGCACGTCCTGACCCTCCTCGTCACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/A_fumigatus_Af293/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : A_fumigatus_Af293 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.109 | 0.103 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28257/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.113 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28257/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.114 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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