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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-21 22:48:05, GGGenome : Aspergillus oryzae (RIB40) genome, s01-m09-r03 (Oct, 2015)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chr8_A_oryzae_RIB40 (3395259 nucleotides)
position: 2103103-2103117
CACCTCAGAACCGGCCTGGGTGAAACGGAA2103103AATGTTGTCAATGAAGAGCAGCACATCCTGACCTTCCTCGTCACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/A_oryzae_RIB40/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : A_oryzae_RIB40 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28280/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.002 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28280/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.085 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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