GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 23:22:07, GGGenome : Amphimedon queenslandica genome, Aqu1 (Oct, 2010)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Contig5586 dna:scaffold scaffold:Aqu1:Contig5586:1:1703:1
position: 1197-1211
CTTTTTGTTACGTTTTGCTGTTCTGCCACT1197TTCATTGACAACATTATAACACATGCTATTTCTATTATCTCAGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Aqu1/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : Aqu1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.077 | 0.069 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28133/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.080 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28133/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.081 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).