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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2024-04-14 06:52:03, GGGenome : Arabidopsis lyrata genome, v.1.0 (Dec, 2008)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

6 dna:chromosome chromosome:v.1.0:6:1:25113588:1
position: 3612279-3612293
AGGAACAAGGCTCACCTGAGTGAAACGGAA3612279AATGTTGTCAATGAAAAGCAAGACGTCTTGGCCTTCGGCATCACG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Araly_v.1.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Araly_v.1.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.089 | 0.080 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28168/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.093 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28168/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.094 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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