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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 00:24:22, GGGenome : Carica papaya genome, ASGPBv0.4

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

supercontig_34:309640-309654
GTATTACCTTTTCTTCCTTTTTAGCCATTC309640TTCATTGACAACATTTGGCTTGAAGAAGGCAGAAGATGCAAAATC
supercontig_34:334726-334740
GTATTACCTTTTCTTCCTTTTTAGCCGTTC334726TTCATTGACAACATTTGGCATGAAGAAGGCAGAAGATGCAAAATC
supercontig_21:2160960-2160974
AGGCTTTGATAGTTTTTAATTGATTGTTTG2160960AATGTTGTCAATGAAGGTCCAGATTAGAAGGAAAAAAAAATCTAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Cpapaya_r.Dec2008/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Cpapaya_r.Dec2008 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.74:28293/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.74:28293/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.086 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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