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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2023-02-08 10:17:17, GGGenome : Glycyrrhiza uralensis genome, release 1 (Aug, 2016)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Scaffold00095
position: 191872-191886
AATGTACAGCTATTTACAGATCAACCATCT191872AATGTTGTCAATGAAAGCACTKTTCCCCTTGTTATGGAAAAAATT
Scaffold05586
position: 3659-3673
TTAATTAGTTGTTGGTCATAGCAAGGTAAC3659AATGTTGTCAATGAAAAGTTAGAGACGATGCAGGGTCAAGTTCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Gur1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Gur1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.077 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28749/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.080 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28749/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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