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2021-10-26 02:43:40, GGGenome : Penicillium marneffei (ATCC 18224) genome, JCVI-PMFA1-2.0 (Oct, 2008)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

NW_002196665.1 Penicillium marneffei ATCC 18224 scf_1105668340984, whole genome shotgun sequence
position: 2505991-2506005
CGGCCAGATATACTGTCTAGGTGGCATTCC2505991TTCATTGACAACATTTTCGCCAAAATACCGCTCACCGTATCCCTC
NW_002196664.1 Penicillium marneffei ATCC 18224 scf_1105668340752, whole genome shotgun sequence
position: 2196758-2196772
CGTGACGAGGAAGGTCAGGACGTGCTTCTC2196758TTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACTCAGGCCGGTTCTGAGGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/JCVI_PMFA1_2.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : JCVI_PMFA1_2.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.077 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28260/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.082 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28260/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.082 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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