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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-12-09 02:42:34, GGGenome : Pediculus humanus genome, PhumU2 (Nov, 2008)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

DS235371 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS235371:1:284323:1
position: 78574-78588
CACGTTCGCTCTTTTTTCTCACTCCCCCCC78574TTCATTGACAACATTCGCGCACGAAACGTTGTTAACTAATCCGTG
DS235283 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS235283:1:462513:1
position: 341788-341802
TTTTTTTTTTCACAACGAAAATTATCCATT341788TTCATTGACAACATTTGAAAATCAGGATCAGGGTCTTATCCTTAA
DS234996 dna:supercontig supercontig:PhumU2:DS234996:1:474860:1
position: 111643-111657
AAATATTATAGGATCTAATTCTTCTCCTTT111643TTCATTGACAACATTTGTAAAAGCCGTTGCCCACGGTTGTCCTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/PhumU2/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : PhumU2 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28156/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.088 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28156/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.088 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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