GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2021-10-26 01:48:19, GGGenome : Selaginella moellendorffii genome, v1.0 (May, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

GL377625 dna:supercontig supercontig:v1.0:GL377625:1:1246421:1
position: 1101291-1101305
GCTATGTTGCATGACTACTTCCTGATGCCA1101291TTCATTGACAACATTCTCAATGCCATAGATGGTCATGAAATCTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Selml_v1.0/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Selml_v1.0 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.079 | 0.071 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28195/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28195/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.083 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).