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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-22 08:37:46, GGGenome : Strigamia maritima genome, Smar1 (Feb, 2013)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

JH431854 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH431854:1:146329:1
position: 33690-33704
CAACCAAAACCACAAAACAACATAAATCTT33690TTCATTGACAACATTCAATGGCAAAACACATATAGCATCATGAAC
JH432105 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH432105:1:558451:1
position: 552321-552335
CCATATAGAAATATGGAAAAATAGTTCACT552321TTCATTGACAACATTGTTCTCTCTCTTTCTAAATGAAATATAGAA
JH431380 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH431380:1:254879:1
position: 237282-237296
ATCATTCTCTATAAAACGTAGAAAAAGAAA237282AATGTTGTCAATGAAAAGGTCAGGTCGGCTTTCAACTCTGATATA
JH432114 dna:scaffold scaffold:Smar1:JH432114:1:1273652:1
position: 1025624-1025638
TCGTGTTTCGAGGCATATATTTTTGTTTTA1025624AATGTTGTCAATGAACAATAATAATTCGAGCGCTGTTTATTATGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Smar1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Smar1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.078 | 0.070 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28160/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28160/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.084 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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