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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2021-12-01 12:43:44, GGGenome : Selaginella moellendorffii genome, v1.0 (Dec, 2007)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

scaffold_60:1101291-1101305
GCTATGTTGCATGACTACTTCCTGATGCCA1101291TTCATTGACAACATTCTCAATGCCATAGATGGTCATGAAATCTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Smoellendorffii_91_v1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Smoellendorffii_91_v1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.080 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.74:28288/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.74:28288/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.084 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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