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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2021-04-23 17:57:32, GGGenome : Sorghum bicolor genome, NCBIv3 (Jun, 2017)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

7 dna:chromosome chromosome:Sorghum_bicolor_NCBIv3:7:1:65505356:1 REF
position: 60663698-60663712
TCAGGATTTCAGCACCATACACTGTGGGGC60663698AATGTTGTCAATGAACTGATAAGCAATATTAACTGTACATAGGTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Sorbi3/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Sorbi3 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.077 | 0.069 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28200/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.080 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28200/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.081 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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