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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2021-12-05 13:15:03, GGGenome : Tetrahymena malaccensis genome (Oct, 2012)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

supercont2.87 of Tetrahymena malaccensis
position: 244148-244162
ATTTAGTATTTTTTTATTGGTAAGTTAACA244148AATGTTGTCAATGAATTTTGATTTATAAATATTTGACTAATTTGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Tetma/AATGTTGTCAATGAA
lang : ja | db : Tetma | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AATGTTGTCAATGAA | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.148 | 0.140 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28251/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.156 | 0.008 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28251/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.156 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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