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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2024-11-22 09:07:59, GGGenome : Trichinella spiralis genome, Tspiralis1 (Mar, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

GL622785 dna:chromosome chromosome:Tspiralis1:GL622785:1:11347909:1
position: 639386-639400
TCTCTACTTCAGATAGAAGTTCATCTTGGC639386AATGTTGTCAATGAAATGGCTAATTATATATTGAATAAAGTTGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/Tspiralis1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Tspiralis1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.081 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28163/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.003 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28163/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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