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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-04-26 22:49:39, GGGenome : Xenopus tropicalis genome, XenBase/JGI 8.0

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Chr01:
154015828-154015842
ATAGGGTTCAGTTATGACTGCAACTGTGCG154015828TTCATTGACAACATTTATCCAGGTTTCTTCTGTGCAAATCGCTCC
Chr02:
149270438-149270452
AGGGAGTGGTGTGTGGAACTGGTATTCCAG149270438TTCATTGACAACATTACCTTGAAATAAATGGGGTTTGGAGGCAGA
Chr07:
67222791-67222805
ACGGGCATCTGAAAATGTGAAAATACCACA67222791TTCATTGACAACATTGTATTGAGAAGTTTATAAAATAATGTGAAG
scaffold_61:
419397-419411
CACTCTCACAATATTCAATATTTTGGTTGC419397TTCATTGACAACATTATTCTTATATGGTCCGGTACCGATGAACAA
Chr04:
96548353-96548367
CCAATAGCTTTGGGAATGAGCAGTGTAAGC96548353AATGTTGTCAATGAAACAAAATTATACAGGCCAATAACTTATTAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/Xentr8/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : Xentr8 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.083 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28226/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.089 | 0.006 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28226/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.089 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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