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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2024-11-24 15:17:04, GGGenome : Ramazzottius variornatus (YOKOZUNA-1) genome (Sep, 2016)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

BDGG01000001.1 Ramazzottius varieornatus DNA, contig: Scaffold001, strain: YOKOZUNA-1.
position: 4274547-4274561
CGTGATCAAGAGGGTCAGGATGTGTTGCTC4274547TTCATTGACAACATTTTCCGCTTCACCCAAGCTGGTTCGGAGGTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/YOKOZUNA-1/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : YOKOZUNA-1 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.72:28267/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.087 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.72:28267/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.087 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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