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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2021-04-23 18:00:05, GGGenome : Vigna angularis genome, ver3 (Nov, 2011)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

scaffold_543
position: 59473-59487
TCCTCAAGTTGGAAGTTCTTACGCGTATTT59473TTCATTGACAACATTATTTACTAGAGGTCCTTCACCATTTAGTGT
6
position: 1865416-1865430
TATATTTAGGTTTGCAGAATTATAGATGAA1865416TTCATTGACAACATTTGCAATGTTGGTGACCACTTGCTTACTTTG
5
position: 1967080-1967094
TACACTCTTTTGCTACATAACCACACAATT1967080AATGTTGTCAATGAAAAATTGACGGAATAGATTTAATTGATACAC
scaffold_273
position: 287501-287515
TGATGCAATTCTCACTTCTTCACTGTAGAG287501AATGTTGTCAATGAATATGGACTGATTGAACATCTGGAATTTGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/adzuki_ver3/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : adzuki_ver3 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.082 | 0.074 | search_plus_done; http://172.18.8.77:28238/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.086 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.77:28238/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.087 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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