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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2024-02-28 08:11:33, GGGenome : C. remanei genome, WUGSC 15.0.1/caeRem3 (May, 2007)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

chrUn:108941169-108941183
AAAAAAGTTCAGAAAAATCAATGTTTTCTC108941169TTCATTGACAACATTGTAAATCACAACAAATTTGCAGATTCAAGT
chrUn:138795702-138795716
CGTGACCAGGAAGGACAAGATGTGCTTCTC138795702TTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACTCAAGCCGGATCAGAAGTG
chrUn:3831058-3831072
GGCGAAGAATAATACGAGATTTTGCGGGAA3831058AATGTTGTCAATGAAAACGTACAAATATCAAATGCGTACTTTTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/caeRem3/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : caeRem3 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.084 | 0.076 | search_plus_done; http://172.18.8.76:28111/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.089 | 0.005 | search_minus_done; http://172.18.8.76:28111/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.089 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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