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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2021-04-23 17:18:53, GGGenome : Marmoset spliced RNA, TRaC 20.03 on calJacRKC1912, D3G 20.03 (Mar, 2020)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

ENSCJAG00000014861;TRaC2003L1a84b|MIR4785|chr6:92541779:92607037:-|spliced
position: 1184-1198
AAGTTCCAAAGTAAATTTGCATTATATGCT1184AATGTTGTCAATGAATAGAATATAAATGTGCTACTTTGCTGCAAT
ENSCJAG00000014861;TRaC2003L1a84c|RBMS1|chr6:92557172:92686106:-|spliced
position: 1297-1311
AAGTTCCAAAGTAAATTTGCATTATATGCT1297AATGTTGTCAATGAATAGAATATAAATGTGCTACTTTGCTGCAAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : http://gggenome.dbcls.jp/ja/calJacRKC1912_Trac2003_spliced_d3g2003/TTCATTGACAACATT
lang : ja | db : calJacRKC1912_Trac2003_spliced_d3g2003 | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : TTCATTGACAACATT | format : html | download : | debug :

0.007 | 0.007 | search_start;
0.079 | 0.072 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28812/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.083 | 0.004 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28812/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.084 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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