GGGenome | Results

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2025-04-06 04:45:22, GGGenome : Marmoset genome, calJacRKC1912 (Dec, 2019)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

chr2
position: 44989381-44989395

TTAAGTCTTCTTAATTTACATTGCTATTAT44989381TTCATTGACAACATTAATAACTGTGTAACAAACTATGCAAGTTTT

chr2
position: 184253246-184253260

GTGGTGCCTGGCCTGAGTCAGCACATTAGC184253246TTCATTGACAACATTGGTTCATTCAACAAATAATTGCCTGAGAAG

chr4
position: 167363610-167363624

CTTTCAAATATTTTACAGAGTTTGACTCTT167363610TTCATTGACAACATTAACACCACCCAAAAGAGAAACGTGAGCCAA

chr5
position: 42098707-42098721

CATATCTCAAAATAAGAGCCATCCAATGGG42098707TTCATTGACAACATTATGCTGAATGGGTAAAAGCTGGAAGCATTT

chr6
position: 92566165-92566179

ATTGCAGCAAAGTAGCACATTTATATTCTA92566165TTCATTGACAACATTAGCATATAATGCAAATTTACTTTGGAACTT

chr9
position: 41676410-41676424

TACATGAATCTACATGACTTTTCATTCTTT41676410TTCATTGACAACATTTCATGGAAAGAAATTCTACAGGAGAGGGTT

chr10
position: 51619658-51619672

CAGAAATTTTGGAAATGCTACTGTTGCTTT51619658TTCATTGACAACATTAGCTGGGACTGTATTAAATATCAAATATAT

chr19
position: 37649492-37649506

GCATACGGAGAAACTGGATAGCAAAATAAA37649492TTCATTGACAACATTTCCAACAAAACTAGGTGACAAACCATGAAT

chr1
position: 29627070-29627084

GTTGTCACCTCAGTGTGAGTTACCTCAGGC29627070AATGTTGTCAATGAATACAGCCTCCAGGGAGAAACTTCAGACTGC

chr3
position: 24928352-24928366

TGTAGTCAGCAAATAGTTAATTGCTGTTTA24928352AATGTTGTCAATGAAAAGGAGTATTACACAAAATCAGAGGATTTA

chr3
position: 80048043-80048057

ATATGAAAATTCAATAAAAGTACATTACAA80048043AATGTTGTCAATGAAATTGTAATTATTTTTCAGACTATGACATTA

chr4
position: 88414603-88414617

TTTAGGTTTTATGTAGTTTTCAGATTGTAT88414603AATGTTGTCAATGAATTCAAGTAAAAACAAACTTCAAATGAGACA

chr7
position: 104870853-104870867

AATGAGACTCGAGTTGGCATCTTCATGGGC104870853AATGTTGTCAATGAACTGTTTTCTCAGCAGCCTCCTGGTGAGTGA

chr10
position: 34724846-34724860

GAAAAAAAACCCAGAACTTTTAAAATGAAA34724846AATGTTGTCAATGAAACTAAAAATATCTTGGACAAGTTTAACATA

chr11
position: 38520572-38520586

CACACAAAGCCATGCTTCCTGAATCCATAA38520572AATGTTGTCAATGAAATGGTTAAAATTGTTGTATATATTGTGTCC

chr13
position: 13714366-13714380

TCTGAGACATGACACCTGGGTTTAGATCCT13714366AATGTTGTCAATGAACACAACTTCTTTGGTCATTCCCAATATATT

chrX
position: 107976730-107976744

TATGCCTTTCTCTTAATGTACAAGTAAATA107976730AATGTTGTCAATGAAATGGGAATTTTTATTGGGTTGGGGATTTGT

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Debug Info:

0.009 | 0.009 | search_start;
0.082 | 0.073 | search_plus_done; http://172.18.8.75:28815/match?q=TTCATTGACAACATT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.092 | 0.010 | search_minus_done; http://172.18.8.75:28815/match?q=AATGTTGTCAATGAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=42
0.098 | 0.006 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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