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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-20 07:23:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

T221056b Medicago truncatula BAC library Medicago truncatula genomic clone 11N15, genomic survey sequence.
AZ757877.1:1-26
1AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCCTTAAATCAAGTTACATGCTAATTCTGCATC
Medicago truncatula clone mth2-97k23, WORKING DRAFT SEQUENCE.
AC225514.3:49791-49816
CTCATTGCTGATTCTGGTGCCATTGGTTCT49791AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCCTTAAATCAAGTTACATGCTAATTCTGCATC
Medicago truncatula chromosome 6 clone mth2-9p1, complete sequence.
AC127020.16:120288-120313
CTCATTGCTGATTCTGGTGCCATTGGTTCT120288AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCCTTAAATCAAGTTACATGCTAATTCTGCATC
Medicago truncatula chromosome 6 clone mth2-155p7, WORKING DRAFT SEQUENCE, 7 ordered pieces.
AC157778.10:69351-69376
GATGCAGAATTAGCATGTAACTTGATTTAA69351GGGTCAAATAGTGTGGATTCAAGCTTAGAACCAATGGCACCAGAATCAGCAATGAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.128 | 0.120 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGCTTGAATCCACACTATTTGACCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.171 | 0.043 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGTCAAATAGTGTGGATTCAAGCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.172 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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